alleen voor onderzoeksdoeleinden
Cat.nr.S8071
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK Histone Acetyltransferase |
|---|---|
| Overig Histone Methyltransferase Inhibitoren | Pinometostat (EPZ5676) 3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride BIX-01294 trihydrochloride UNC1999 EPZ015666 (GSK3235025) EPZ004777 MM-102 (HMTase Inhibitor IX) Chaetocin SGC 0946 EPZ005687 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 22Rv1 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human 22Rv1 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.048 μM | ||||
| PC3 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human PC3 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.059 μM | ||||
| MCF7 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human MCF7 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.07 μM | ||||
| MDA-MB-231 cells | Function assay | 48 h | Inhibition of G9a in human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by clonogenic assay, IC50=0.081 μM | |||
| IMR90 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human IMR90 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.12 μM | ||||
| HCT116 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human HCT116 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.21 μM | ||||
| H1299 cells | Function assay | 0.25 uM | 24 h | Inhibition of G9a expressed in H1299 cells assessed as inhibition of dimethylation of p53 at lys 373 at 0.25 uM after 24 hrs by Western blot analysis | ||
| Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken | ||||||
| Molecuulgewicht | 509.73 | Formule | C30H47N5O2 |
Opslag (vanaf de datum van ontvangst) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 1255580-76-7 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
|
In vitro |
DMSO
: 100 mg/mL
(196.18 mM)
Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
G9a
(Cell-free assay) <15 nM
GLP
(Cell-free assay) 19 nM
|
|---|---|
| In vitro |
UNC0638 is een potente, selectieve en celpenetrerende chemische probe voor G9a en GLP, met een toxiciteit/functie-ratio van >100, vergeleken met <6 voor BIX01294. Deze verbinding is een selectieve remmer van G9a en GLP over een breed scala aan epigenetische en niet-epigenetische doelen. Het is meer dan 10.000 keer selectief tegen SET7/9 (een H3K4 HMTase), SET8 (een H4K20 HMTase), PRMT3 en SUV39H2. In MDA-MB-231 cellen vermindert deze chemische stof (48 uur blootstelling) de H3K9me2 niveaus op een concentratie-afhankelijke manier met een IC50 van 81 nM. De behandeling van een verscheidenheid aan cellijnen resulteert in lagere globale H3K9me2 niveaus, equivalent aan niveaus waargenomen voor kleine hairpin RNA knockdown van G9a en GLP, waarbij de functionele potentie van deze verbinding goed gescheiden is van zijn toxiciteit. Het vermindert de clonogeniciteit van MCF7 cellen aanzienlijk, vermindert de abundantie van H3K9me2 markeringen bij promoters van bekende G9a-gereguleerde endogene genen en benvloedt onevenredig verschillende genomische loci die microRNA's coderen. In muizen embryonale stamcellen reactiveert deze probe G9a-gesilenceerde genen en een retroviraal reportergen op een concentratie-afhankelijke manier zonder differentiatie te bevorderen.
|
| Kinase Assay |
SAHH-gekoppelde assays
|
|
Deze assay maakt gebruik van SAHH om het methyltransferproduct S-adenosylhomocystene te hydrolyseren tot homocystene en adenosine in aanwezigheid van adenosine deaminase dat adenosine omzet in inosine. De homocysteneconcentratie wordt vervolgens bepaald door conjugatie van zijn vrije sulfhydrylgroep aan een thiol-gevoelige fluorofoor, ThioGlo. Voor IC50-bepalingen worden assaymengsels bereid in 25 mM kaliumfosfaatbuffer pH 7.5, 1 mM EDTA, 2 mM MgCl2, 0.01% Triton X 100 met 5 M SAHH, 0.3 U/mL adenosine deaminase, 25 M SAM en 15 M ThioGlo. G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3 en SUV39H2 worden getest bij respectievelijk 25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 M en 100 nM. UNC0638 wordt toegevoegd in concentraties vari rend van 4 nM tot 16 M. Na 2 min incubatie worden reacties geni erd door toevoeging van de histone peptiden: 10 M H3(1-25) voor G9a, 20 M H3(1-25) voor EHMT1, 100 M H3(1-25) voor SETD7, 500 M H4(1-24) voor SETD8, 10 M H4(1-24) voor PRMT3 en 200 M H3K9Me1 (1-15) voor SUV39H2. De methyleringsreactie wordt gevolgd door monitoring van de toename in fluorescentie met behulp van een Biotek Synergy2 plaatlezer met 360/40 nm excitatie filter en 528/20 nm emissie filter gedurende 20 min in een 384-wells plaatformaat. Activiteitswaarden worden gecorrigeerd door achtergrond veroorzaakt door het peptide of het eiwit af te trekken. IC50-waarden worden berekend met Sigmaplot. Standaardafwijkingen worden berekend uit twee onafhankelijke experimenten.
|
|
| In vivo |
In farmacokinetische en geneesmiddelmetabolisme studies bij muizen, had UNC0638 een hoge klaring, korte halfwaardetijd, hoog distributievolume en lage blootstelling na intraveneuze, orale of intraperitoneale toediening. Hoewel deze verbinding waarschijnlijk niet geschikt is voor in vivo dierstudies vanwege de lage blootstellingsniveaus, maakt de hoge stabiliteit onder cellulaire assaycondities, in combinatie met hoge potentie en selectiviteit, het een ideaal chemisch hulpmiddel voor celgebaseerde studies.
|
Referenties |
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.