alleen voor onderzoeksdoeleinden
Cat.nr.S8068
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK Histone Acetyltransferase |
|---|---|
| Overig Histone Methyltransferase Inhibitoren | Pinometostat (EPZ5676) 3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride BIX-01294 trihydrochloride UNC1999 EPZ015666 (GSK3235025) EPZ004777 MM-102 (HMTase Inhibitor IX) SGC 0946 EPZ005687 UNC0638 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| A549 | Cytotoxicity assay | Cytotoxicity against human A549 cells, IC50 = 0.025 μM. | 20303767 | |||
| Hep3b | Function assay | Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF expression in human Hep3b cells by luciferase reporter gene assay, IC50 = 0.04 μM. | 22305612 | |||
| Hep3b | Function assay | Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF secretion in human Hep3b cells by ELISA, IC50 = 0.1 μM. | 22305612 | |||
| Jurkat | Cytotoxicity assay | 40 hrs | Cytotoxicity against human Jurkat cells after 40 hrs bioluminescence assay, IC50 = 0.6 μM. | 20303767 | ||
| Drosophila melanogaster SL2 | Function assay | 0.1 uM | 5 days | Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.1 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density | 16408017 | |
| Drosophila melanogaster SL2 | Function assay | 0.5 uM | 5 days | Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.5 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density | 16408017 | |
| Drosophila melanogaster SL2 | Function assay | 0.5 uM | Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me3 at 0.5 uM by immunostaining method | 16408017 | ||
| HL60 | Apoptosis assay | 30 uM | 4 hrs | Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as necrotic cell death at 30 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis | 20675131 | |
| HL60 | Apoptosis assay | 0.3 uM | 4 hrs | Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as nuclear fragmentation at 0.3 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis | 20675131 | |
| HL60 | Apoptosis assay | 0.3 uM | 2 hrs | Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as activation of caspase 3 at 0.3 uM after 2 hrs by Western blot analysis | 20675131 | |
| MCF7 | Function assay | Inhibition of histone-lysine N-methyltransferase in human MCF7 cells assessed as decrease in methylation of RARbeta DNA by qPCR method | ChEMBL | |||
| Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken | ||||||
| Molecuulgewicht | 696.84 | Formule | C30H28N6O6S4 |
Opslag (vanaf de datum van ontvangst) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 28097-03-2 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
|
In vitro |
DMSO
: 25 mg/mL
(35.87 mM)
Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
dSU(VAR)3-9
0.8 μM
mouse G9a
2.5 μM
Neurospora crassa DIM5
3 μM
|
|---|---|
| In vitro |
In SL-2 Drosophila-weefselkweekcellen veroorzaakt Chaetocin de remming van SU(VAR)3-9 en het aantal H3-moleculen dat gedimethylateerd is op Lys9, en remt het ook de celgroei. In HepG2, Hep3B en Huh7 humane hepatomacellen remt deze verbinding HIF-1-gemedieerde hypoxische responsen. Het remt ook krachtig de proliferatie en kolonieformatie in een breed scala aan kankercellijnen met IC50 van 2-10 nM. |
| Kinase Assay |
Methylatieassays
|
|
Tenzij anders vermeld, worden reacties als volgt uitgevoerd: 1 g gezuiverd enzym (dSU(VAR)3-9 213; GST-hSUV39H1(82-412); GST-ncDIM5(19-318) en GSTmG9a(621-1000); dPRSET7(1-691); His-SET7/9(109-366) of enzymcomplex uitgedrukt in een baculoviraal expressiesysteem (dE(z), dSU(Z)12, dp55, dESC)) werden 30 minuten geïncubeerd met 1 g van een peptide dat de eerste 19 aminozuren van H3 plus een extra cysteïneresidu (ARTKQTARKSTGGKAPRKQC) bevatte in een totaal volume van 40 μl in BC25 (10 mM HEPES pH 7,6, 25 mM NaCl, 1 mM EDTA, 10% glycerol). Alle enzymen, behalve het E(z)-complex, hadden een vergelijkbare specifieke activiteit tussen 5-10 nmole/min/mg. Voor het E(z)-complex is de specifieke activiteit ongeveer 5-10 keer lager, wat waarschijnlijk te wijten is aan een onvolledige vorming van het volledige complex dat nodig is voor de hoogste activiteit. Als methyldonor is S-Adenosyl[methyl-3H]methionine (SAM) aanwezig in de reactie in een eindconcentratie van 40 M met een specifieke activiteit van 0,3 Ci/mmole. Reacties worden gestopt door 1/10 volume van 100% azijnzuur toe te voegen en de incorporatie van radioactiviteit wordt gemeten door 30 μl van de reactie op P81-filterpapier te spotten en vervolgens scintellatietelling uit te voeren. Voor de inhibitorscreening wordt 1 μl van deze verbinding met een concentratie van 10 g/l aan elke reactie toegevoegd. In de gevallen waarin PRSET7 of het E(z)-complex als enzym wordt gebruikt, vervingen recombinant nucleosomen (1 g) of recombinant H3 (1 g) respectievelijk het H3-peptide als substraat.
|
|
| In vivo |
Bij Hepa 1c1c-7 tumor-dragende muizen remt Chaetocin (0,25 mg/kg, i.p.) de tumorgroei door deregulatie van HIF-1[alpha]-gemedieerde angiogenese. Bij SKOV3 tumor-dragende naaktmuizen vertraagt de behandeling met deze verbinding (0,25 mg/kg, i.p.) de tumorgroei significant met minimale aanwijzingen van toxiciteit. |
Referenties |
|
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | Procaspase-3 / Cleaved Caspase-3 / PARP |
|
26890137 |
| Growth inhibition assay | Cell viability |
|
18176557 |
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.