alleen voor onderzoeksdoeleinden

Chaetocin Histone Methyltransferase remmer

Cat.nr.S8068

Chaetocin, een natuurproduct van Chaetomium-soorten, is een histon-methyltransferase-remmer met IC50 van 0,8 μM, 2,5 μM en 3 μM voor respectievelijk dSU(VAR)3-9, muis G9a en Neurospora crassa DIM5. Chaetocin is een antikankermiddel en remmer van thioredoxin reductase (TrxR).
Chaetocin Histone Methyltransferase remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 696.84

Spring naar

Kwaliteitscontrole

Batch: Zuiverheid: 99.82%
99.82

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
A549 Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human A549 cells, IC50 = 0.025 μM. 20303767
Hep3b Function assay Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF expression in human Hep3b cells by luciferase reporter gene assay, IC50 = 0.04 μM. 22305612
Hep3b Function assay Inhibition of HIF-1alpha-mediated VEGF secretion in human Hep3b cells by ELISA, IC50 = 0.1 μM. 22305612
Jurkat Cytotoxicity assay 40 hrs Cytotoxicity against human Jurkat cells after 40 hrs bioluminescence assay, IC50 = 0.6 μM. 20303767
Drosophila melanogaster SL2 Function assay 0.1 uM 5 days Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.1 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density 16408017
Drosophila melanogaster SL2 Function assay 0.5 uM 5 days Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me2 at 0.5 uM after 5 days by MALDI-TOF MS seeded at 2.5 million cells/ml density 16408017
Drosophila melanogaster SL2 Function assay 0.5 uM Inhibition of SU(VAR)3-9 in Drosophila melanogaster SL2 cells assessed as reduction of H3K9me3 at 0.5 uM by immunostaining method 16408017
HL60 Apoptosis assay 30 uM 4 hrs Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as necrotic cell death at 30 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis 20675131
HL60 Apoptosis assay 0.3 uM 4 hrs Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as nuclear fragmentation at 0.3 uM after 4 hrs using DAPI/PI by confocal laser microscopy analysis 20675131
HL60 Apoptosis assay 0.3 uM 2 hrs Induction of apoptosis in human HL60 cells assessed as activation of caspase 3 at 0.3 uM after 2 hrs by Western blot analysis 20675131
MCF7 Function assay Inhibition of histone-lysine N-methyltransferase in human MCF7 cells assessed as decrease in methylation of RARbeta DNA by qPCR method ChEMBL
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit

Molecuulgewicht 696.84 Formule

C30H28N6O6S4

Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 28097-03-2 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Oplosbaarheid

In vitro
Batch:

DMSO : 25 mg/mL (35.87 mM)
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme

Targets/IC50/Ki
dSU(VAR)3-9
0.8 μM
mouse G9a
2.5 μM
Neurospora crassa DIM5
3 μM
In vitro

In SL-2 Drosophila-weefselkweekcellen veroorzaakt Chaetocin de remming van SU(VAR)3-9 en het aantal H3-moleculen dat gedimethylateerd is op Lys9, en remt het ook de celgroei.

In HepG2, Hep3B en Huh7 humane hepatomacellen remt deze verbinding HIF-1-gemedieerde hypoxische responsen.

Het remt ook krachtig de proliferatie en kolonieformatie in een breed scala aan kankercellijnen met IC50 van 2-10 nM.

Kinase Assay
Methylatieassays
Tenzij anders vermeld, worden reacties als volgt uitgevoerd: 1 g gezuiverd enzym (dSU(VAR)3-9 213; GST-hSUV39H1(82-412); GST-ncDIM5(19-318) en GSTmG9a(621-1000); dPRSET7(1-691); His-SET7/9(109-366) of enzymcomplex uitgedrukt in een baculoviraal expressiesysteem (dE(z), dSU(Z)12, dp55, dESC)) werden 30 minuten geïncubeerd met 1 g van een peptide dat de eerste 19 aminozuren van H3 plus een extra cysteïneresidu (ARTKQTARKSTGGKAPRKQC) bevatte in een totaal volume van 40 μl in BC25 (10 mM HEPES pH 7,6, 25 mM NaCl, 1 mM EDTA, 10% glycerol). Alle enzymen, behalve het E(z)-complex, hadden een vergelijkbare specifieke activiteit tussen 5-10 nmole/min/mg. Voor het E(z)-complex is de specifieke activiteit ongeveer 5-10 keer lager, wat waarschijnlijk te wijten is aan een onvolledige vorming van het volledige complex dat nodig is voor de hoogste activiteit. Als methyldonor is S-Adenosyl[methyl-3H]methionine (SAM) aanwezig in de reactie in een eindconcentratie van 40 M met een specifieke activiteit van 0,3 Ci/mmole. Reacties worden gestopt door 1/10 volume van 100% azijnzuur toe te voegen en de incorporatie van radioactiviteit wordt gemeten door 30 μl van de reactie op P81-filterpapier te spotten en vervolgens scintellatietelling uit te voeren. Voor de inhibitorscreening wordt 1 μl van deze verbinding met een concentratie van 10 g/l aan elke reactie toegevoegd. In de gevallen waarin PRSET7 of het E(z)-complex als enzym wordt gebruikt, vervingen recombinant nucleosomen (1 g) of recombinant H3 (1 g) respectievelijk het H3-peptide als substraat.
In vivo

Bij Hepa 1c1c-7 tumor-dragende muizen remt Chaetocin (0,25 mg/kg, i.p.) de tumorgroei door deregulatie van HIF-1[alpha]-gemedieerde angiogenese.

Bij SKOV3 tumor-dragende naaktmuizen vertraagt de behandeling met deze verbinding (0,25 mg/kg, i.p.) de tumorgroei significant met minimale aanwijzingen van toxiciteit.

Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36070144/

Toepassingen

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot Procaspase-3 / Cleaved Caspase-3 / PARP
S8068-WB1
26890137
Growth inhibition assay Cell viability
S8068-viability1
18176557

Technische ondersteuning

Gebruiksaanwijzing

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.

Voer uw naam in.
Voer uw e-mailadres in. Voer een geldig e-mailadres in.
Schrijf alstublieft iets voor ons.