alleen voor onderzoeksdoeleinden
Cat.nr.S7276
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET Histone Methyltransferase PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK |
|---|---|
| Overig DNA Methyltransferase Inhibitoren | RG108 Zebularine (NSC 309132) GSK3685032 Gamma-Oryzanol CM272 β-thujaplicin Bobcat339 DC-05 2'-Deoxy-5-Fluorocytidine GSK-3484862 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| human U937 cells | Cytotoxicity assay | 48 h | Cytotoxicity against human U937 cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=1.7 μM | |||
| human KARPAS299 cells | Proliferation assay | 2-4 days | Antiproliferative activity against human KARPAS299 cells after 2 to 4 days by ATPlite 1step luminescence assay, EC50=1.8 μM | |||
| human KG1 cells | Proliferation assay | 2-4 days | Antiproliferative activity against human KG1 cells after 2 to 4 days by ATPlite 1step luminescence assay, EC50=4.4 μM | |||
| human MDA-MB-231 cells | Cytotoxicity assay | 48 h | Cytotoxicity against human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=4.8 μM | |||
| human PC3 cells | Cytotoxicity assay | 48 h | Cytotoxicity against human PC3 cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=6.5 μM | |||
| human Raji cells | Cytotoxicity assay | 48 h | Cytotoxicity against human Raji cells after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=9.1 μM | |||
| human PBMC | Cytotoxicity assay | 48 h | Cytotoxicity against human PBMC after 48 hrs by trypan blue exclusion assay, IC50=23.8 μM | |||
| human HCT116 cells | Cytotoxicity assay | Cytotoxicity against human HCT116 cells assessed as viability, TD50=25 μM | ||||
| Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken | ||||||
| Molecuulgewicht | 461.52 | Formule | C27H23N7O |
Opslag (vanaf de datum van ontvangst) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 1020149-73-8 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
| Synoniemen | DNA Methyltransferase Inhibitor II | Smiles | CC1=CC(=NC(=N1)N)NC2=CC=C(C=C2)NC(=O)C3=CC=C(C=C3)NC4=CC=NC5=CC=CC=C54 | ||
|
In vitro |
DMSO
: 68 mg/mL
(147.33 mM)
Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Kenmerken |
Potential for use in epigenetic cancer therapy.
|
|---|---|
| Targets/IC50/Ki |
DNMT1
(Cell-free assay) 6 μM
DNMT3B
(Cell-free assay) 7.5 μM
DNMT3A
(Cell-free assay) 8 μM
|
| In vitro |
SGI-1027 remt DNA-methylering door DNMT's direct te remmen, en resulteert in selectieve afbraak van DNMT1 in een breed scala van menselijke kankercellijnen. Deze verbinding vertoont minimale of geen cytotoxische effecten in rattenhepatoma H4IIE-cellen. Deze chemische stof (0-100 μM) vertoont een matig pro-apoptotisch effect op de U937 humane leukemiecellijn zonder relevante veranderingen in de celcyclus. |
| Kinase Assay |
DNA-methyltransferase (CpG-methyltransferase) assay
|
|
DNA-methylaseactiviteit wordt bepaald door de incorporatie van de 3H1-methylgroep van Ado-Met in DNA te meten met behulp van een DE-81 ionenuitwisselingsfilterbindingstest met enkele modificaties. Humaan recombinant DNMT1, recombinant muis Dnmt3a/Dnmt3b (500 ng) wordt geïncubeerd met 500 ng poly(dI-dC) of hemigemethyleerd DNA-duplex en 75 of 150 nM (0,275 μCi of 0,55 μCi) [methyl-3H]-S-adenosylmethionine (Ado-Met) in een totaal volume van 50 μl bij 37°C gedurende 1 uur. Of M. Sss I wordt getest in de buffer van de leverancier. Elke reactie wordt in duplo uitgevoerd en omvatte controles zonder remmer of zonder DNA. De reactie wordt gestopt door het reactiemengsel op een Whatman DE-81 ionenuitwisselingsfilterdisc te druppelen, te wassen (vijfmaal, elk 10 min, met 0,5M Na-fosfaatbuffer; pH 7,0), te drogen en te tellen in een scintillatieteller. De achtergrondradioactiviteit (geen DNA-controle) wordt afgetrokken van de waarden verkregen met reactiemengsels die DNA bevatten en de radioactiviteit verkregen in de reactie zonder enige remmer wordt beschouwd als 100% activiteit. IC50 wordt bepaald door interpolatie uit de plot van procent activiteit versus remmerconcentratie. Om de aard van de remming van de DNMTase-activiteit door deze verbinding te bepalen, wordt de DNMT1-enzymactiviteit gemeten in aanwezigheid van een vaste concentratie van deze chemische stof (0, 2,5, 5 en 10 μM), terwijl een van de twee (Ado-Met of DNA) werd gevarieerd in een specifiek reactiemengsel. Bij een vaste concentratie DNA (500 ng) variëren de gebruikte concentraties Ado-Met van respectievelijk 25-500 nM. Op vergelijkbare wijze variëren de uiteindelijke DNA-concentraties van (25-500 ng) bij 75 nM Ado-Met.
|
|
| In vivo |
SGI-1027 (DNA Methyltransferase Inhibitor II) is een DNMT-remmer . |
Referenties |
|
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Growth inhibition assay | Cell viability |
|
30344731 |
| Western blot | Bcl-2 / Bax DNMT1 / TIMP3 / P16 |
|
30344731 |
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.