alleen voor onderzoeksdoeleinden
Cat.nr.S2821
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET Histone Methyltransferase PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK |
|---|---|
| Overig DNA Methyltransferase Inhibitoren | SGI-1027 Zebularine (NSC 309132) GSK3685032 Gamma-Oryzanol CM272 β-thujaplicin Bobcat339 DC-05 2'-Deoxy-5-Fluorocytidine GSK-3484862 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| human THP1 cells | Function assay | Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM | 18620381 | |||
| human HepG2 cells | Function assay | Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM | 19167888 | |||
| rat macrophages | Function assay | 24 h | Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM | 19464189 | ||
| MCF7 | Apoptosis assay | 10 uM | 6 hrs | Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control | 25801160 | |
| MCF7 | Apoptosis assay | 10 uM | 6 hrs | Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control | 25801160 | |
| MCF7 | Function assay | 100 uM | 1 hr | Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE | 25801160 | |
| MCF7 | Function assay | 50 to 500 uM | 1 hr | Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER | 25801160 | |
| SK-N-MC | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells | 29435139 | |||
| Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken | ||||||
| Molecuulgewicht | 334.33 | Formule | C19H14N2O4 |
Opslag (vanaf de datum van ontvangst) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 48208-26-0 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
| Synoniemen | N-Phthalyl-L-tryptophan | Smiles | C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O | ||
|
In vitro |
DMSO
: 66 mg/mL
(197.4 mM)
Ethanol : 66 mg/mL Water : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
DNA methyltransferase
(Cell-free assay) 115 nM
|
|---|---|
| In vitro |
RG108 blokkeert DNA methyltransferases in vitro effectief en veroorzaakt geen covalente enzym-trapping in menselijke cellijnen. Incubatie van cellen met lage micromolaire concentraties van deze verbinding resulteert in significante demethylering van genomisch DNA zonder enige detecteerbare toxiciteit. Intrigerend is dat het demethylering en reactivering van tumorsuppressorgenen veroorzaakt, maar het heeft geen invloed op de methylering van centromere satellietssequenties. In een andere studie wordt de synthese en in vitro analyse van een gebiotinyleerd conjugaat van deze chemische stof onderzocht om de interacties met DNA methyltransferase-enzymen te evalueren. In een recente studie is aangetoond dat deze verbinding de DNA methyltransferase-activiteit in van SM afgeleide iPS-cellen significant kan verminderen in vergelijking met de natieve SM's.
|
| Kinase Assay |
In vitro methylatie-assay
|
|
Het substraat-DNA voor de in vitro methylatie-assay is een fragment van 798 bp (−423/+375 ten opzichte van het startcodon) uit het promotorgebied van het menselijke p16Ink4a-gen. De methylatiereactie bevat 350 tot 400 ng substraat-DNA en 4 eenheden M.SssI-methylase (0,5 μM) in een eindvolume van 50 μL. Deze verbinding wordt toegevoegd in eindconcentraties van respectievelijk 10, 100, 200 en 500 μM. Reacties worden gedurende 2 uur bij 37 °C uitgevoerd. Na voltooiing wordt de reactie gedurende 15 minuten bij 65 °C geïnactiveerd en wordt het DNA gezuiverd met behulp van een PCR-zuiveringskit. Driehonderd nanogram gezuiverd DNA wordt gedurende 3 uur bij 60 °C verteerd met 30 eenheden BstUI en geanalyseerd op 2% Tris-boraat EDTA-agarosegels.
|
Referenties |
|
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.