alleen voor onderzoeksdoeleinden

(E/Z)-TG003 CDK remmer

Cat.nr.S7320

(E/Z)-TG003 is een krachtige en ATP-competitieve Cdc2-like kinase (Clk) remmer met een IC50 van respectievelijk 20 nM, 200 nM en 15 nM voor Clk1, Clk2 en Clk4. Geen remmend effect op Clk3, SRPK1, SRPK2 of PKC.
(E/Z)-TG003 CDK remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 249.33

Spring naar

Kwaliteitscontrole

Batch: S732001 DMSO]50 mg/mL]false]Ethanol]50 mg/mL]false]Water]Insoluble]false Zuiverheid: 99.67%
  • Geciteerd in Nature Medicine vanwege de topkwaliteit
  • COA
  • NMR
  • HPLC
  • SDS
  • Datasheet
99.67

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
human STO cells Function assay Modulation of Clk/sty pre-mRNA splicing in human STO cells assessed as concentration required to increase in mature Clk2 mRNA level by RT-PCR analysis, EC50=6.6 μM
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit

Molecuulgewicht 249.33 Formule

C13H15NO2S

Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 300801-52-9 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles CCN1C2=C(C=CC(=C2)OC)SC1=CC(=O)C

Oplosbaarheid

In vitro
Batch:

DMSO : 50 mg/mL (200.53 mM)
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Ethanol : 50 mg/mL

Water : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme

Targets/IC50/Ki
mCLK4
(Cell-free assay)
15 nM
mCLK1
(Cell-free assay)
20 nM
mCLK2
(Cell-free assay)
200 nM
In vitro
TG003 remt SF2/ASF-afhankelijke splicing van humaan β-globine in vitro door onderdrukking van Clk1/Sty-gemedieerde fosforylering. TG003 remt Clk1/Sty kinase-activiteit in zoogdiercellen, terwijl het geen toxisch effect heeft op de groei van HeLa- en COS-7-cellen bij een concentratie van 10 μM. TG003 blokkeert IL-1β RNA-productie door bloedplaatjes door de splicing van IL-1β heteronucleair RNA te remmen. Tijdens 3T3-L1 adipocytendifferentiatie blokkeert TG003 ook alternatieve splicing van PKCβII en expressie van PPARγ1 en PPARγ2.
Kinase Assay
In vitro kinase assay
De kinase-activiteit van Clks en SRPKs wordt getest in een reactiemengsel dat 200 mM Tris-HCl (pH 7.5), 12.5 mM MgCl2, 8 mM dithiothreitol, 4 mM EGTA, 1–20 μM ATP, 1 μCi [γ-32P]ATP, 1 μg synthetisch peptide van SF2/ASF RS-domein (NH2-RSPSYGRSRSRSRSRSRSRSRSNSRSRSY-OH), en 0.1–1 μg gezuiverde kinases bevat in een eindvolume van 40 μL. cAMP-afhankelijke proteïnekinase-activiteit wordt getest in een reactiemengsel dat 80 mM Tris-HCl (pH 7.5), 12.5 mM MgCl2, 8 mM dithiothreitol, 4 mM EGTA, 10 μM ATP, 1 μCi [γ-32P]ATP, 5 μg histone H1, en 1 μg van de gezuiverde katalytische subeenheid van ratten cAMP-afhankelijke proteïnekinase bevat. Proteïnekinase C-activiteit wordt getest in een reactiemengsel dat 200 mM Tris-HCl (pH 7.5), 12.5 mM MgCl2, 1 mM CaCl2, 80 μg/mL phosphatidylserine, 8 μg/mL diolein, 10 μM ATP, 1 μCi [γ-32P]ATP, 5 μg histone H1, en 2 μL van gedeeltelijk gezuiverde ratten proteïnekinase C bevat. De uiteindelijke concentratie Me2SO wordt aangepast tot 1%, ongeacht de inhibitorconcentratie. Het reactiemengsel wordt gedurende 10 min geïncubeerd bij 30 of 25 °C voor respectievelijk recombinante zoogdier- of Xenopus-eiwitten, en een halve portie wordt op een P81-fosfocellulosemembraan gespot. De kinase-assaycondities, inclusief de incubatieperiode en de concentratie van kinases en substraten, zijn geoptimaliseerd om de lineariteit tijdens incubatie te handhaven. Het membraan wordt gedurende ten minste 15 min gewassen met 5% fosforzuuroplossing (SF2/ASF RS-domein) of 5% trichloorazijnzuuroplossing (histone H1). De radioactiviteit wordt gemeten met een vloeistofscintillatieteller. De netto radioactiviteit wordt afgeleid door de achtergrondtelling van het reactiemengsel zonder kinase af te trekken, en de gegevens worden uitgedrukt als percentage van het controlesample dat het oplosmiddel bevat.
In vivo
TG003 (10 μM) herstelt de embryonale defecten veroorzaakt door overmatige Clk-activiteit in Xenopus.
Referenties

Toepassingen

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot CLK1 / SRPK1
S7320-WB1
27397683
Immunofluorescence tubulin / emerin
S7320-IF1
27015110

Technische ondersteuning

Gebruiksaanwijzing

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.

Voer uw naam in.
Voer uw e-mailadres in. Voer een geldig e-mailadres in.
Schrijf alstublieft iets voor ons.