alleen voor onderzoeksdoeleinden

Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK remmer

Cat.nr.S1574

Doramapimod (BIRB 796) is een pan-p38 MAPK-remmer met IC50 van 38 nM, 65 nM, 200 nM en 520 nM voor p38α/β/γ/δ in celvrije assays. Het bindt p38α met Kd van 0,1 nM in THP-1 cellen, met 330-voudig hogere selectiviteit versus JNK2, zwakke remming voor c-RAF, Fyn en Lck, en onbeduidende remming van ERK-1, SYK, IKK2.
Doramapimod (BIRB 796) p38 MAPK remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 527.66

Spring naar

Kwaliteitscontrole

Batch: Zuiverheid: 99.99%
99.99

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
HOP-92 Growth Inhibition Assay IC50=24.3838 μM SANGER
NCI-H2228 Growth Inhibition Assay IC50=23.6668 μM SANGER
CAPAN-1 Growth Inhibition Assay IC50=22.1884 μM SANGER
SK-MEL-1 Growth Inhibition Assay IC50=20.3683 μM SANGER
DB Growth Inhibition Assay IC50=18.7923 μM SANGER
AN3-CA Growth Inhibition Assay IC50=18.1 μM SANGER
EW-13 Growth Inhibition Assay IC50=17.9516 μM SANGER
LC-2-ad Growth Inhibition Assay IC50=17.4366 μM SANGER
ES8 Growth Inhibition Assay IC50=17.167 μM SANGER
NCI-H1581 Growth Inhibition Assay IC50=17.0447 μM SANGER
HMV-II Growth Inhibition Assay IC50=14.2309 μM SANGER
BEN Growth Inhibition Assay IC50=13.1264 μM SANGER
NBsusSR Growth Inhibition Assay IC50=10.8235 μM SANGER
MS-1 Growth Inhibition Assay IC50=10.8235 μM SANGER
BFTC-905 Growth Inhibition Assay IC50=10.1233 μM SANGER
NCI-SNU-1 Growth Inhibition Assay IC50=9.06739 μM SANGER
MPP-89 Growth Inhibition Assay IC50=8.46251 μM SANGER
T-24 Growth Inhibition Assay IC50=8.40673 μM SANGER
KP-N-YN Growth Inhibition Assay IC50=8.2019 μM SANGER
IST-MES1 Growth Inhibition Assay IC50=7.95637 μM SANGER
NCI-H358 Growth Inhibition Assay IC50=7.538 μM SANGER
GOTO Growth Inhibition Assay IC50=6.39161 μM SANGER
DU-145 Growth Inhibition Assay IC50=3.93811 μM SANGER
EoL-1-cell Growth Inhibition Assay IC50=0.34763 μM SANGER
KYSE-270 Growth Inhibition Assay IC50=24.5573 μM SANGER
HCC1806 Growth Inhibition Assay IC50=24.7799 μM SANGER
HuO-3N1 Growth Inhibition Assay IC50=25.8185 μM SANGER
HOS Growth Inhibition Assay IC50=25.9292 μM SANGER
KYSE-510 Growth Inhibition Assay IC50=26.1612 μM SANGER
COLO-741 Growth Inhibition Assay IC50=26.3329 μM SANGER
H-EMC-SS Growth Inhibition Assay IC50=26.9245 μM SANGER
HCC1937 Growth Inhibition Assay IC50=27.2238 μM SANGER
NCI-H2126 Growth Inhibition Assay IC50=27.3975 μM SANGER
NCI-H1703 Growth Inhibition Assay IC50=28.0413 μM SANGER
U-2-OS Growth Inhibition Assay IC50=28.5515 μM SANGER
DBTRG-05MG Growth Inhibition Assay IC50=28.5651 μM SANGER
MHH-ES-1 Growth Inhibition Assay IC50=31.941 μM SANGER
HCC1419 Growth Inhibition Assay IC50=32.1119 μM SANGER
HOP-62 Growth Inhibition Assay IC50=32.2701 μM SANGER
AM-38 Growth Inhibition Assay IC50=32.9931 μM SANGER
NCI-H2009 Growth Inhibition Assay IC50=33.4007 μM SANGER
EM-2 Growth Inhibition Assay IC50=33.5511 μM SANGER
SW1116 Growth Inhibition Assay IC50=34.4838 μM SANGER
SK-N-AS Growth Inhibition Assay IC50=35.0714 μM SANGER
ChaGo-K-1 Growth Inhibition Assay IC50=35.6032 μM SANGER
RT-112 Growth Inhibition Assay IC50=35.9879 μM SANGER
HTC-C3 Growth Inhibition Assay IC50=36.2355 μM SANGER
SK-NEP-1 Growth Inhibition Assay IC50=36.6106 μM SANGER
LB831-BLC Growth Inhibition Assay IC50=37.6541 μM SANGER
CTB-1 Growth Inhibition Assay IC50=38.4512 μM SANGER
MOLT-4 Growth Inhibition Assay IC50=38.8391 μM SANGER
SW756 Growth Inhibition Assay IC50=40.9385 μM SANGER
CAL-72 Growth Inhibition Assay IC50=42.03 μM SANGER
KNS-62 Growth Inhibition Assay IC50=42.6296 μM SANGER
KARPAS-299 Growth Inhibition Assay IC50=43.3233 μM SANGER
HEL Growth Inhibition Assay IC50=45.4646 μM SANGER
KP-4 Growth Inhibition Assay IC50=46.7361 μM SANGER
NEC8 Growth Inhibition Assay IC50=47.1661 μM SANGER
G-402 Growth Inhibition Assay IC50=48.7012 μM SANGER
Sf21 Function assay Binding affinity to wild type human biotin labelled p38 alpha (9 to 352 residues) expressed in sf21 insect cells SPR analysis, Kd = 0.000123 μM. 28834431
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.013 μM. 18325768
U937 Antiinflammatory assay 2 hrs Antiinflammatory activity in differentiated human U937 cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production preincubated for 2 hrs followed by LPS-stimulation for 4 hrs by sandwich ELISA relative to vehicle-treated control, IC50 = 0.015 μM. 26800309
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 19356929
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced tumor necrosis factor-alpha (TNF-alpha) production in THP-1 cells, EC50 = 0.018 μM. 12086485
THP Function assay Tested for inhibition of Tumor necrosis factor, alpha in THP cells, EC50 = 0.018 μM. 14561087
THP1 Function assay Inhibition of LPS-induced TNFalpha production in THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 17560108
THP1 Function assay Inhibition of LPS-stimulated TNFalpha production in human THP1 cells, IC50 = 0.018 μM. 18462940
HLF Function assay Inhibition of p38alpha phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.047 μM. 18602262
HLF Function assay Inhibition of HSP27 phosphorylation in IL-1-alpha-stimulated HLF cells, IC50 = 0.058 μM. 18602262
HEK293F Function assay Inhibition of sodium arsenate activated N-terminal GST-tagged Brugia malayi MPK1 expressed in HEK293F cells using FAM-p38tide as substrate by IMAP assay, IC50 = 0.14 μM. 29541362
BL21(DE3) Function assay Inhibition of p38alpha active form expressed in Escherichia coli BL21(DE3) cells by HTRF assay, IC50 = 0.25 μM. 19928858
whole blood cells Antiinflammatory assay 4 hrs Antiinflammatory activity in human whole blood cells assessed as inhibition of LPS-induced TNFalpha production after 4 hrs by time-resolved fluorescence assay, IC50 = 0.6 μM. 22749282
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit

Molecuulgewicht 527.66 Formule

C31H37N5O3

Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 285983-48-4 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles CC1=CC=C(C=C1)N2C(=CC(=N2)C(C)(C)C)NC(=O)NC3=CC=C(C4=CC=CC=C43)OCCN5CCOCC5

Oplosbaarheid

In vitro
Batch:

DMSO : 100 mg/mL (189.51 mM)
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Ethanol : 100 mg/mL

Water : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme

Kenmerken
The first p38 MAPK inhibitor to be tested in a phase III clinical trial.
Targets/IC50/Ki
JNK2
c-RAF
Fyn
p38α
(Cell-free assay)
0.1 nM(Kd)
p38α
38 nM
In vitro

Doramapimod (BIRB 796) vertoont geen significante remming van ERK-1, SYK, IKK2β, ZAP-70, EGF-receptorkinase, HER2, proteïnekinase A (PKA), PKC, PKC-α, PKC-β (I en II) en PKC-γ. Deze verbinding verbetert de bindingsaffiniteit aanzienlijk door een waterstofbrug te vormen tussen het morfolinezuurstof en het ATP-bindende domein van p38α. Het vertegenwoordigt een van de meest potente en langzaamst dissocierende remmers tegen humane p38 MAP-kinase die nu bekend zijn.

Het remt c-Raf-1 en Jnk2α2 potent met respectievelijk IC50 van 1,4 en 0,1 nM.

BIRB796 remt ook de activiteit en de activering van SAPK3/p38γ bij een hogere concentratie dan bij p38α. Het blokkeert de stress-geïnduceerde fosforylering van het scaffoldproteïne SAP97, een fysiologisch substraat van SAPK3/p38γ. Deze verbinding blokkeert JNK1/2-activering en -activiteit in HEK293-cellen, terwijl het de activering en activiteit van ERK1/ERK2 in Hela-cellen niet remt. Bovendien belemmert de binding van BIRB796 aan de p38 MAPKs of JNK1/2 hun fosforylering door de stroomopwaartse kinase MKK6 of MKK4 in plaats van hun defosforylering te verbeteren.

Het blokkeert de basale en opregulatie van p38 MAPK en Hsp27-fosforylering, waardoor de cytotoxiciteit en caspase-activering worden verbeterd. Deze verbinding reguleert de IL-6- en VEGF-secretie in BMSC's, die worden geactiveerd door TNF-α en TGF-β1, neerwaarts.

Het heeft een pyrazool-structuur die een lipofiele t-butylgroep in de onderste selectiviteitsplaats en een tolylring in de bovenste selectiviteitsplaats plaatst. Deze verbinding remt ook B-Raf en Abl met respectievelijk IC50 van 83 nM en 14,6 μM.

Kinase Assay
Procedures voor de THP-1 cellulaire assay voor remming van LPS-gestimuleerde TNF-α productie
THP-1 cellen worden gedurende 30 minuten gepreïncubeerd in aanwezigheid en afwezigheid van Doramapimod (BIRB 796). Het celmengsel wordt gestimuleerd met LPS (1 μg/mL finaal) en de incubatie wordt 's nachts (18-24 uur) voortgezet zoals hierboven. Supernatant wordt geanalyseerd op humane TNF-α met een commercieel verkrijgbare ELISA. Gegevens worden gecombineerd en geanalyseerd met niet-lineaire regressie met behulp van een drie-parameter logistisch model om een EC50-waarde te verkrijgen. Deze verbinding wordt in elk experiment geanalyseerd en de 95% betrouwbaarheidsintervallen voor de EC50 liggen tussen 16 en 22 nM.
In vivo

Doramapimod (BIRB 796) (30 mg/kg) remt 84% van TNF-α in LPS-gestimuleerde muizen en toont werkzaamheid in een muismodel van gevestigde collageen-geïnduceerde artritis.

Deze verbinding heeft goede farmacokinetische prestaties, zelfs na orale toediening bij muizen.

Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17173546/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20621496/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561087/

Toepassingen

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot p-p38 / γ-H2AX mTOR / p-S6K / S6K / p-MK2 / MK2 / p-Hsp27 / Hsp27 p-p38 / p38
S1574-WB3
27082306

Informatie over klinische proeven

(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)

NCT-nummer Werving Aandoeningen Sponsor/medewerkers Startdatum Fasen
NCT02211885 Completed
Healthy
Boehringer Ingelheim
October 2002 Phase 1

Technische ondersteuning

Gebruiksaanwijzing

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

Als u nog andere vragen heeft, laat dan een bericht achter.

Voer uw naam in.
Voer uw e-mailadres in. Voer een geldig e-mailadres in.
Schrijf alstublieft iets voor ons.