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N° Cat.S8071
| Cibles apparentées | HDAC JAK BET PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK Histone Acetyltransferase |
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| Autre Histone Methyltransferase Inhibiteurs | Pinometostat (EPZ5676) 3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride BIX-01294 trihydrochloride UNC1999 EPZ015666 (GSK3235025) EPZ004777 MM-102 (HMTase Inhibitor IX) Chaetocin SGC 0946 EPZ005687 |
| Lignées cellulaires | Type dessai | Concentration | Temps dincubation | Formulation | Description de lactivité | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 22Rv1 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human 22Rv1 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.048 μM | ||||
| PC3 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human PC3 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.059 μM | ||||
| MCF7 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human MCF7 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.07 μM | ||||
| MDA-MB-231 cells | Function assay | 48 h | Inhibition of G9a in human MDA-MB-231 cells after 48 hrs by clonogenic assay, IC50=0.081 μM | |||
| IMR90 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human IMR90 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.12 μM | ||||
| HCT116 cells | Function assay | Inhibition of G9a in human HCT116 cells assessed as reduction of H3K9me2 after 48 hrs by In-Cell Western assay, IC50=0.21 μM | ||||
| H1299 cells | Function assay | 0.25 uM | 24 h | Inhibition of G9a expressed in H1299 cells assessed as inhibition of dimethylation of p53 at lys 373 at 0.25 uM after 24 hrs by Western blot analysis | ||
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| Poids moléculaire | 509.73 | Formule | C30H47N5O2 |
Stockage (À partir de la date de réception) | |
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| N° CAS | 1255580-76-7 | Télécharger le SDF | Stockage des solutions mères |
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In vitro |
DMSO
: 100 mg/mL
(196.18 mM)
Water : Insoluble Ethanol : Insoluble |
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In vivo |
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Étape 1 : Entrez les informations ci-dessous (Recommandé : Un animal supplémentaire pour tenir compte des pertes pendant lexpérience)
Étape 2 : Entrez la formulation in vivo (Ceci nest que le calculateur, pas la formulation. Veuillez nous contacter dabord sil ny a pas de formulation in vivo dans la section Solubilité.)
Résultats du calcul :
Concentration de travail : mg/ml;
Méthode de préparation du liquide maître DMSO : mg médicament prédissous dans μL DMSO ( Concentration du liquide maître mg/mL, Veuillez nous contacter dabord si la concentration dépasse la solubilité du DMSO du lot de médicament. )
Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuiteμL PEG300, mélanger et clarifier, ajouter ensuiteμL Tween 80, mélanger et clarifier, ajouter ensuite μL ddH2O, mélanger et clarifier.
Méthode de préparation de la formulation in vivo : Prendre μL DMSO liquide maître, ajouter ensuite μL Huile de maïs, mélanger et clarifier.
Remarque : 1. Assurez-vous que le liquide est clair avant dajouter le solvant suivant.
2. Assurez-vous dajouter le(s) solvant(s) dans lordre. Vous devez vous assurer que la solution obtenue lors de lajout précédent est une solution claire avant de procéder à lajout du solvant suivant. Des méthodes physiques telles que le vortex, les ultrasons ou le bain-marie peuvent être utilisées pour faciliter la dissolution.
| Targets/IC50/Ki |
G9a
(Cell-free assay) <15 nM
GLP
(Cell-free assay) 19 nM
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| In vitro |
UNC0638 est une sonde chimique puissante, sélective et pénétrant les cellules pour G9a et GLP, avec un rapport toxicité/fonction >100, comparé à <6 pour BIX01294. Ce composé est un inhibiteur sélectif de G9a et GLP sur un large éventail de cibles épigénétiques et non-épigénétiques. Il est plus de 10 000 fois sélectif contre SET7/9 (une HMTase H3K4), SET8 (une HMTase H4K20), PRMT3 et SUV39H2. Dans les cellules MDA-MB-231, cette substance chimique (exposition de 48 h) réduit les niveaux de H3K9me2 de manière concentration-dépendante avec une IC50 de 81 nM. Son traitement d'une variété de lignées cellulaires entraîne des niveaux globaux de H3K9me2 plus faibles, équivalents aux niveaux observés pour le knockdown par petit ARN en épingle à cheveux de G9a et GLP, la puissance fonctionnelle de ce composé étant bien séparée de sa toxicité. Il réduit considérablement la clonogénicité des cellules MCF7, réduit l'abondance des marques H3K9me2 au niveau des promoteurs de gènes endogènes connus régulés par G9a et affecte de manière disproportionnée plusieurs loci génomiques codant des microARN. Dans les cellules souches embryonnaires de souris, cette sonde réactive les gènes silencieux par G9a et un gène rapporteur rétroviral de manière concentration-dépendante sans favoriser la différenciation.
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| Kinase Assay |
Tests couplés à la SAHH
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Ce dosage utilise la SAHH pour hydrolyser le produit de méthyltransférase S-adénosylhomocystéine en homocystéine et adénosine en présence d'adénosine désaminase qui convertit l'adénosine en inosine. La concentration d'homocystéine est ensuite déterminée par conjugaison de sa partie sulfhydryle libre à un fluorophore sensible aux thiols, le ThioGlo. Pour les déterminations d'IC50, les mélanges de dosage sont préparés dans un tampon phosphate de potassium 25 mM pH 7.5, 1 mM EDTA, 2 mM MgCl2, 0.01% Triton X 100 avec 5 μM SAHH, 0.3 U/mL d'adénosine désaminase, 25 μM SAM et 15 μM ThioGlo. G9a, EHMT1, SETD7, SETD8, PRMT3 et SUV39H2 sont dosés respectivement à 25 nM, 100 nM, 200 nM, 250 nM, 1 μM et 100 nM. UNC0638 est ajouté à des concentrations allant de 4 nM à 16 μM. Après 2 minutes d'incubation, les réactions sont initiées par addition des peptides d'histone : 10 μM H3(1-25) pour G9a, 20 μM H3(1-25) pour EHMT1, 100 μM H3(1-25) pour SETD7, 500 μM H4(1-24) pour SETD8, 10 μM H4(1-24) pour PRMT3 et 200 μM H3K9Me1 (1-15) pour SUV39H2. La réaction de méthylation est suivie en surveillant l'augmentation de la fluorescence à l'aide d'un lecteur de plaques Biotek Synergy2 avec un filtre d'excitation 360/40 nm et un filtre d'émission 528/20 nm pendant 20 minutes dans un format de plaque à 384 puits. Les valeurs d'activité sont corrigées en soustrayant le bruit de fond causé par le peptide ou la protéine. Les valeurs d'IC50 sont calculées à l'aide de Sigmaplot. Les écarts types sont calculés à partir de deux expériences indépendantes.
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| In vivo |
Dans des études de métabolisme et de pharmacocinétique de médicaments chez la souris, UNC0638 a montré une clairance élevée, une demi-vie courte, un volume de distribution élevé et une faible exposition après administration intraveineuse, orale ou intrapéritonéale. Ainsi, bien que ce composé ne soit probablement pas adapté aux études animales in vivo en raison de faibles niveaux d'exposition, sa grande stabilité dans les conditions de dosage cellulaire, en combinaison avec une puissance et une sélectivité élevées, en fait un outil chimique idéal pour les études basées sur les cellules.
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Références |
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