uitsluitend voor onderzoeksdoeleinden
Cat.Nr.S7165
| Gerelateerde doelwitten | HDAC JAK BET PKC PARP HIF PRMT EZH2 AMPK Histone Acetyltransferase |
|---|---|
| Overige Histone Methyltransferase Inhibitoren | Pinometostat (EPZ5676) 3-Deazaneplanocin A (DZNep) Hydrochloride BIX-01294 trihydrochloride EPZ015666 (GSK3235025) EPZ004777 MM-102 (HMTase Inhibitor IX) Chaetocin SGC 0946 EPZ005687 UNC0638 |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| human MCF10A cells | Function assay | 72 h | Inhibition of EZH2 in human MCF10A cells assessed as reduction of H3K27me3 level after 72 hrs by Western blot analysis, IC50=0.124 μM | 25406853 | ||
| human MCF10A cells | Cytotoxic assay | Cytotoxicity against human MCF10A cells assessed as cell viability by Alamar Blue assay, EC50=19.2 μM | 25406853 | |||
| Klik om meer experimentele gegevens over de cellijn te bekijken | ||||||
| Moleculair gewicht | 569.74 | Formule | C33H43N7O2 |
Opslag (Vanaf de ontvangstdatum) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 1431612-23-5 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
| Synoniemen | N/A | Smiles | CCCC1=C(C(=O)NC(=C1)C)CNC(=O)C2=C3C=NN(C3=CC(=C2)C4=CN=C(C=C4)N5CCN(CC5)C(C)C)C(C)C | ||
|
In vitro |
DMSO
: 100 mg/mL
(175.51 mM)
Ethanol : 100 mg/mL Water : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer de onderstaande informatie in (Aanbevolen: Een extra dier voor het geval van verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in het gedeelte Oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-mastervloeistof: mg geneesmiddel vooraf opgelost in μL DMSO ( Concentratie mastervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de partij geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toeμL PEG300, mengen en helder maken, voeg vervolgens toeμL Tween 80, mengen en helder maken, voeg vervolgens toe μL ddH2O, mengen en helder maken.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO mastervloeistof, voeg vervolgens toe μL Maïsolie, mengen en helder maken.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysische methoden zoals vortexen, echografie of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Kenmerken |
The first orally bioavailable inhibitor against wild-type and mutant EZH2 as well as EZH1.
|
|---|---|
| Targets/IC50/Ki |
EZH2
(Cell-free assay) 2 nM
EZH1
(Cell-free assay) 45 nM
|
| In vitro |
UNC1999 is in vitro zeer potent voor zowel EZH2 Y641N als EZH2 Y641F mutanten. Deze verbinding veroorzaakt concentratieafhankelijke reducties van H3K27me3 in MCF10A-cellen met een IC50 van 124 nM, terwijl het een lage cellulaire toxiciteit vertoont. Het vertoont een potente, concentratieafhankelijke remming van celproliferatie met een EC50 van 633 nM in een DLBCL-cellijn die de EZH2Y641N-mutant herbergt. Bovendien verrijkt gebiotinyleerde UNC1999 EZH2 uit HEK293T-celysaten, en kan dus worden gebruikt in chemoproteomische studies.
|
| Kinase Assay |
Scintillatie Proximity Assay
|
|
Methyltransferase-activiteitstesten worden uitgevoerd door de incorporatie van tritiumgelabelde methylgroepen van S-adenosylmethionine (3H-SAM) in gebiotinyleerde peptidesubstraten te monitoren met behulp van Scintillation Proximity Assay (SPA) voor het PRC2-EZH2 trimerische complex (EZH2:EED:SUZ12), PRC2-EZH1 pentamerische complex (EZH1:EED:SUZ12:RBBP4:AEBP2), SETD7, G9a, GLP, SETDB1, SETD8, SUV420H1, SUV420H2, SUV39H2, MLL1 tetramerische complex (MLL:WDR5:RbBP5:ASH2L), PRMT1, PRMT3, PRMT5-MEP50 complex en SMYD2. De reactiebuffer voor SMYD2 en SMYD3 is 50 mM Tris pH 9.0, 5 mM DTT, 0.01% TritonX-100; voor G9a, GLP en SUV39H2 is 25 mM kaliumfosfaat pH 8.0, 1 mM EDTA, 2 mM MgCl2 en 0.01% Triton X-100; en voor andere HMT's 20 mM Tris pH 8.0, 5 mM DTT, 0.01% TritonX-100. Om de enzymatische reacties te stoppen, wordt 10 μL van 7.5 M guanidinehydrochloride toegevoegd, gevolgd door 180 μL buffer, gemengd en overgebracht naar een 384-wells FlashPlate. Na het mengen worden de reactiemengsels geïncubeerd en worden de CPM-tellingen gemeten met behulp van een Topcount plaatlezer. De CPM-tellingen in afwezigheid van deze verbinding voor elke dataset worden gedefinieerd als 100% activiteit. In afwezigheid van het enzym worden de CPM-tellingen in elke dataset gedefinieerd als achtergrond (0%). IC50-waarden worden bepaald met behulp van compoundconcentraties variërend van 100 nM tot 100 μM. De IC50-waarden worden bepaald met behulp van SigmaPlot-software. EZH2-Y641F-testen worden uitgevoerd met 30 nM enzym in 20 mM Tris pH 8, 5 mM DTT, 0.01% Triton X-100, 5 μM SAM en 1 μM H3 (1-24) peptide (hetzelfde als voor het wild-type PRC2-EZH2-complex). Voor DNMT1 wordt de test uitgevoerd met hemigemethyleerd dsDNA als substraat. Het dsDNA-substraat wordt bereid door twee complementaire strengen (gebiotinyleerde voorwaartse streng: BGAGCCCGTAAGCCCGTTCAGGTCG en omgekeerde streng: CGACCTGAACGGGCTTACGGGCTC), gesynthetiseerd door Eurofins MWG Operon, te hybridiseren. De reactiebuffer is 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 5 mM DTT, 0.01% Triton X-100. Methyltransferase-activiteitstesten voor DOT1L worden uitgevoerd met filterplaten. Reactiemengsels in 20 mM Tris-HCl, pH 8.0, 5 mM DTT, 2 mM MgCl2 en 0.01% Triton X-100 worden 1 uur bij kamertemperatuur geïncubeerd, 100 μL 10% TCA wordt toegevoegd, gemengd en overgebracht naar een filterplaat. Platen worden gecentrifugeerd bij 2000 tpm gedurende 2 minuten, gevolgd door 2 extra wasbeurten met 10% TCA en één ethanolwas (180 μL), gevolgd door centrifugatie. Platen worden gedroogd en 100 μL MicroO wordt toegevoegd en gecentrifugeerd. 70 μL MicroO wordt toegevoegd en CPM wordt gemeten met behulp van een Topcount plaatlezer.
|
|
| In vivo |
Behandeling met UNC1999 (150 en 50 mg/kg, i.p.) resulteert in plasmaconcentraties van deze verbinding boven de cellulaire IC50 gedurende 24 uur in vivo. Bovendien is het ook oraal biologisch beschikbaar bij muizen, wat chronische dierstudies praktischer en handiger maakt.
|
Referenties |
|
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | H3K27Me3 / Cleaved PARP / LC3B H3K27me2 / H3K27me1 / H3K27ac / H3K4me3 / H3K9me2 / H3K36me2 |
|
27449082 |
| Immunofluorescence | EZH2 / H3K27me3 NF-κB |
|
23614352 |
| Growth inhibition assay | Cell viability |
|
27449082 |
Tel: +1-832-582-8158 Ext:3
Als u nog andere vragen heeft, kunt u een bericht achterlaten.