Hygromycin B

Hygromycin B heeft een enkele bindingsplaats binnen het 30S, het bevindt zich in de grote groef van de helix zeer dicht bij de helicale as en maakt contact met nucleotiden van beide RNA-strengen in de regio 1490-1500 en 1400–1410. Ring I van HygB is betrokken bij sequentie-onafhankelijke interacties met de fosfaat zuurstofatomen van de ruggengraat van G1494, naast base-specifieke interacties met G1494 en U1495. Ringen II en III vormen zwakke base-specifieke waterstofbruggen met zowel C1404 als U1498, maar hun hoofdfunctie is blijkbaar om ring IV te positioneren voor interactie met basen in de 1496–1498 regio. Ring IV van HygB komt binnen 4Å van de tweede base van het P-site gebonden mRNA-codon. [1]

Deze verbinding (0,38 mM) stopt de groei van gistcellen in rijke media volledig. Het blokkeert sterk de Polypeptide synthese in celvrije extracten van konijnenreticulocyten, tarwekiem en gist. Het remt peptideketenverlenging door gistpolysomen door translocatie afhankelijk van elongatiefactor EF-2 te voorkomen. [2]

Dit Antibiotic remt (80%) de elongatie-factor-(EF)G-plus-GTP-afhankelijke reactie van ofwel AcPhe-tRNA of natuurlijk peptidyl-tRNA met puromycine in Escherichia coli celvrije systemen. Het blokkeert de beginnende peptideketens van ofwel gezuiverde endogene E. coli polysomen of poly(uridylzuur)-geprogrammeerde ribosomes tijdens polypeptide synthese. Het remt de niet-enzymatische translocatie en de afgifte van AcPhe-tRNA van de ribosomale acceptorplaats, bevorderd door depletie van NH4-ionen. [3]

Het wordt gebruikt voor resistentieselectie in muis-L-cellen getransfecteerd met Escherichia coli genen die coderen voor resistentie tegen de aminocyclitol Antibiotics Hygromycin B. [4]

Deze chemische stof wordt gebruikt als een selecteerbare marker voor T-DNA-overdracht en -integratie in de ectomycorrhizale schimmel Suillus bovinus. [5]