Neomycin sulfate

Neomycine interageert bij voorkeur met het ribozym-substraatcomplex en deze interactie leidt tot een vermindering van de splijtingssnelheid door de grondtoestand van het complex te stabiliseren en de overgangstoestand van de splijtingsstap te destabiliseren. [1] Neomycine bewerkstelligt een conformationele verandering in de structuur van het trans-activerende gebied (TAR) die kan worden gedetecteerd door circulaire dichroïsmespectroscopie. Neomycine werkt als een niet-competitieve remmer die kan binden aan het Tat-TAR-complex en de snelheidsconstante (koff) voor dissociatie van het peptide van het RNA kan verhogen. [2] Neomycine is het meest effectieve aminoglycoside (groefbinder) bij het stabiliseren van een DNA-triplehelix. Neomycine stabiliseert TAT, evenals gemengd-base DNA-triplexen, beter dan bekende DNA-kleine groefbinders (die de triplex meestal destabiliseren) en polyaminen. Neomycine toont een voorkeur voor stabilisatie van TAT-triplets, maar kan ook CGC(+)-triplets accommoderen. [3] Neomycine induceert een concentratie- en spanningsafhankelijk partiële blokkade van zowel de cytosolische als de luminale zijde van het kanaal. Neomycine heeft een grotere affiniteit voor de luminale interactieplaats dan voor de cytosolische plaats: nul-spanning dissociatieconstanten (Kb(0)) zijn respectievelijk 210,20 nM en 589,70 nM voor luminale en cytosolische blokkade. Neomycine vertoont ook spanningsafhankelijke verlichting van de blokkade bij houdpotentialen >+60 mV. [4]