Home Microbiology Reverse Transcriptase inhibitor Zidovudine

alleen voor onderzoeksdoeleinden

Zidovudine Reverse Transcriptase inhibitor

Cat.nr.: S2579

Zidovudine (ZDV, Azidothymidine, NSC 602670) is a nucleoside analogue reverse transcriptase inhibitor, used to treat HIV. This compound could decrease the HDR efficiency and decrease CRISPR-mediated sequence-specific genome knockin events while increaseing knockout efficiency.
Zidovudine Reverse Transcriptase inhibitor Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 267.24

Spring naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: 99.90%
99.90

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
human C8166 cells Function assay Antiviral activity against Human immunodeficiency virus 1 infected in human C8166 cells assessed as inhibition of virus-induced cytopathic effect, EC50=4e-06 μM
PBMC Function assay 1 μM Antiviral activity against HIV1 TEKI replication in PBMC at 1 uM, IC50=0.00014 μM
human H9 cells Function assay 6 days Antiviral activity against Human immunodeficiency virus 1 3B infected in human H9 cells infected with 6.25 uL of virus stock assessed as expression of p24 antigen after 6 days postinfection by ELISA, IC50=0.3 nM
AA5 cells Function assay Antiviral activity against of Human immunodeficiency virus 1 3B infected in AA5 cells infected with 1.56 uL of virus stock assessed as inhibition of viral Reverse transcriptase by [3H]TTP incorporation assay, IC50=0.3 nM
CEM cells Function assay Concentration of the drug resulting in 50% reduction of the viral cytopathic effect against HIV-1 replication in CEM cells, EC50=0.32 nM
MT4 cells Function assay 4 days Antiviral activity against HIV1 3B assessed as inhibition of virus-induced cytopathogenicity in MT4 cells after 4 days by MTT assay, EC50=0.7 nM
human MT2 cells Function assay 1 h Antiviral activity against HIV1 subtype B-3B infected in 1 hr-pretreated human MT2 cells assessed as inhibition of multicycle replication measured on day 5 postinfection by RT SPA, EC50=1.2 nM
C8166 cells Function assay Inhibition of HIV1-3B replication in C8166 cells, EC50=1.9 nM
CEM-SS cell Function assay Inhibitory activity against the HIV-1-induced cytopathic effect in CEM-SS cell line, IC50=0.002 μM
PBLs Function assay Antiviral activity against subtype isolate G strain in PBLs (peripheral blood lymphocytes), IC50=0.002 μM
human lymphocyte CEM/0 cell line Function assay Anti HIV-1 activity in human lymphocyte CEM/0 cell line, EC50=0.003 μM
Jurkat cell Function assay Inhibitory concentration against HIV-1 infected Jurkat cell lines, IC50=0.01 μM
human H9 cells Cytotoxicity assay 6 days Cytotoxicity against human H9 cells after 6 days by MTT assay, EC50=0.01 μM
C3H/3T3 cells Function assay Concentration of compound required to inhibit HIV-1 induced cytopathogenicity of MSV-induced transformation of C3H/3T3 cells by 50%, EC50=0.02 μM
U937 cells Function assay Effective concentration required for antiviral activity against Macrophage cell line of U937 cells of Human by XTT assay, EC50=0.03 μM
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Molecuulgewicht 267.24 Formule

C10H13N5O4

 Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 30516-87-1 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen Azidothymidine, NSC 602670 Smiles CC1=CN(C(=O)NC1=O)C2CC(C(O2)CO)N=[N+]=[N-]

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

DMSO : 53 mg/mL (198.32 mM)
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Ethanol : 53 mg/mL

Water : 26 mg/mL

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
Reverse transcriptase
In vitro

Zidovudine-voorbehandeling heeft een krachtige anti-HIV-1-activiteit in de nieuw geïnfecteerde T- en monocytische cellen, maar niet in chronisch geïnfecteerde cellen. Remming van reverse transcriptie door deze verbinding vermindert p24-antigeenniveaus bescheiden, verminderde HIV-1 gag met 19-voudig, en remt de detectie van 2-LTR HIV-1 DNA. Deze verbinding en dideoxynucleosiden putten wild-type mitochondriaal DNA-niveaus uit en verhogen gedeleteerde mitochondriale DNA-niveaus in gekweekte Kearns-Sayre-syndroomfibroblasten. Deze chemische stof (AZT, 0,1-50 mM) heeft een concentratieafhankelijk onderdrukkend effect op de groei van kolonies afkomstig van granulocyt-monocyt-kolonievormende eenheden (CFU-GM). Blootstelling aan deze verbinding induceert ook een concentratieafhankelijk onderdrukkend effect (35-90%) op de genexpressie van de GM-CSF-receptor type alpha (GM-CSFR alpha). Het veroorzaakt een veel lagere afname (15-22%) van het IL-3-receptor type alpha (IL-3R alpha) boodschapniveau, en heeft een onbeduidend effect op glyceraldehyde 3-fosfaat dehydrogenase (GAPDH) en c-myc boodschapniveaus. Deze chemische stof veroorzaakt een concentratieafhankelijke remming in de niveaus van het mRNA van Epo-receptoren en c-fos, terwijl het niveau van c-myc-mRNA onaangetast blijft. Het remt ook proteïnekinase C (PKC) activiteit op een concentratie- en tijdsafhankelijke manier, wat 50% remming veroorzaakt bij 10 mM binnen 3 uur. De door deze verbinding geïnduceerde down-regulatie van Epo-receptoren en c-fos-expressie, gekoppeld aan remming van Epo-receptor-gemedieerde signaaltransductie via PKC, zijn significante bijdragende factoren aan AZT-geïnduceerde erythroïde toxiciteit. Deze verbinding zou de HDR-efficiëntie kunnen verlagen. Het vermindert CRISPR-gemedieerde sequentie-specifieke gen-knockin-gebeurtenissen terwijl het de knock-out-efficiëntie verhoogt.
Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12084393/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7646543/
  • [6] https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4461869/

Informatie over klinische proeven (Clinical Trial Information)

(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)

NCT-nummer Werving Aandoeningen Sponsor/medewerkers Startdatum Fasen
NCT03991013 Completed
HIV Infections
University of Cape Town|Wellcome Trust|Médecins Sans Frontières Belgium
 August 8 2019 Phase 2
NCT03642704 Completed
Mother to Child HIV Transmission
ANRS Emerging Infectious Diseases
 February 22 2017 Phase 4

Veelgestelde vragen (Frequently Asked Questions)

Vraag 1:
Do you happen to have any information regarding its half-life?

Antwoord:
Its half-life in human is available (http://www.rxlist.com/retrovir-drug/clinical-pharmacology.htm), about 0.5-3 hours in adult subjects.