Home Epigenetics HDAC Remmer Tubastatin A Hydrochloride

alleen voor onderzoeksdoeleinden

Tubastatin A Hydrochloride HDAC6-remmer

Cat.nr.S2627

Tubastatin A HCl is een krachtige en selectieve HDAC6-remmer met een IC50 van 15 nM in een celvrije assay. Het is selectief (1000-voudig meer) tegen alle andere isozymen, behalve HDAC8 (57-voudig meer).
Tubastatin A Hydrochloride HDAC Remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 371.86

Spring naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: 99.30%
99.30

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
neuron cultures Kinase assay 2.5 μM DMSO induces α-tubulin hyperacetylation
neuron cultures Function assay ~10 μM DMSO protects against glutathione depletion-induced oxidative stress
134/04 Function assay 7.5 µM impairs myotube formation
C2C12 Function assay 7.5 µM impairs myotube formation
HaCaT keratinocytes Function assay 10 μM blocks arsenite from inducing Nrf2 protein translation
JURL-MK1 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
CML-T1 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
K562 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
HL-60 Function assay 10 μM enhances cell adhesivity to fibronectin
KMCH Growth inhibitory assay ~10 μM decreases proliferation and anchorage-independent growth
THP-1 Function assay ~10 μM inhibits TNF-α and IL-6 secretion
RAW 264.7 Function assay ~10 μM attenuates NO production
HT3 Function assay ~5 μM DMSO induces the differential α-tubulin acetylation
SiHa Function assay ~5 μM DMSO induces the differential α-tubulin acetylation
CaSki Function assay ~5 μM DMSO induces the differential α-tubulin acetylation
SiHa Function assay ~5 μM DMSO inhibits Thapsigargin- or EGF-induced SOCE activation
CaSki Function assay ~5 μM DMSO inhibits Thapsigargin- or EGF-induced SOCE activation
MCF-7 Growth inhibitory assay 30 μM DMSO IC50=15 μM
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO increases the microtubule acetylation level.
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO stabilizes microtubules against cold-induced depolymerization
MCF-7 Function assay 15 μM DMSO stabilizes microtubules against nocodazole-induced disassembly
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO alteres the assembly dynamics of interphase microtubules
MCF-7 Function assay 30 μM DMSO increases the binding of HDAC6 with interphase microtubules
PC12 Function assay ~3 μM DMSO up-regulates anti-oxidative gene expression related to transcription factor XBP1s
PC12 Growth inhibitory assay ~3 μM DMSO reverse H2O2-induced growth inhibition
HEK293T Function assay ~3 μM DMSO up-regulated XBP1s protein level
HEK293T Function assay ~3 μM DMSO delays XBP1s protein degradation via acetylation-mediated proteasomal degradation
Huh7 Function assay ~5 μM DMSO suppresses proliferation of hepatitis C virus replicon with EC50 = 0.3 μM
SKMEL21 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
SKMEL103 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
SKMEL28 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM164 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM1361a Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM1366 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM793 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM35 Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM983a Growth inhibitory assay ~500 nM DMSO inhibits cell proliferation
WM793 Function assay ~6 μM DMSO induce G1 arrest
WM164 Function assay ~6 μM DMSO induce G1 arrest
WM983a Function assay ~6 μM DMSO induce G1 arrest
WM164 Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
WM983a Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
IPC298 Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
SKMEL30 Function assay ~3 μM DMSO augments expression of MHC class I and melanoma associated antigens
TCa83 Function assay induces PTEN expression and membrane translocation
293T Function assay ~2 μg/ml induces PTEN expression and membrane translocation
SACC-83 Function assay ~2 μg/ml induces PTEN expression and membrane translocation
293T Function assay ~2 μg/ml induces PTEN acetylation at K163
U-87 MG Function assay ~2 μg/ml inhibits the migration and invasion
U-87 MG Function assay ~10 μM inhibits AKT phosphorylation
U-87 MG Growth inhibitory assay ~10 μM inhibits cell growth
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Molecuulgewicht 371.86 Formule

C20H21N3O2.HCl

 Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 1310693-92-5 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

DMSO : 100 mg/mL (268.91 mM) Verwarmd met een waterbad van 50°C; Geultrasoneerd;
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
HDAC6
(Cell-free assay)
15 nM
HDAC8
(Cell-free assay)
854 nM
In vitro
Tubastatin A is aanzienlijk selectief voor alle 11 HDAC-isoformen en behoudt een meer dan 1000-voudige selectiviteit tegen alle isoformen, met uitzondering van HDAC8, waar het ongeveer 57-voudige selectiviteit heeft. In homocysteïnezuur (HCA) geïnduceerde neurodegeneratie-assays vertoont Tubastatin A dosisafhankelijke bescherming tegen HCA-geïnduceerde neuronale celdood, beginnend bij 5 μM met bijna volledige bescherming bij 10 μM. Bij 100 ng/mL verhoogt Tubastatin A de onderdrukking van T-celproliferatie door Foxp3+ T-regulerende cellen (Tregs) in vitro. Behandeling met Tubastatin A in C2C12-cellen zou leiden tot een verminderde myotubevorming wanneer alfa-tubuline vroeg in het myogenetische proces hypergeacetyleerd is; echter, myotubelongatie treedt op wanneer alfa-tubuline hypergeacetyleerd is in myotubes. Een recente studie geeft aan dat Tubastatin A-behandeling de celelasticiteit verhoogt, zoals gebleken uit atoomkrachtmicroscopie (AFM)-tests, zonder drastische veranderingen aan de actine-microfilament- of microtubulusnetwerken in muizen eierstokkankercellijnen, MOSE-E en MOSE-L.
Kinase Assay
Enzymremmingsassays
Enzymremmingsassays worden uitgevoerd door de Reaction Biology Corporation, Malvern, PA, met behulp van het Reaction Biology HDAC Spectrum platform. (www.reactionbiology.com) De HDAC1, 2, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 en 11 assays gebruiken geïsoleerd recombinant humaan eiwit; het HDAC3/NcoR2-complex wordt gebruikt voor de HDAC3-assay. Het substraat voor de HDAC1, 2, 3, 6, 10 en 11 assays is een fluorogeen peptide van p53-residuen 379-382 (RHKKAc); het substraat voor HDAC8 is een fluorogeen diacylpeptide gebaseerd op residuen 379-382 van p53 (RHKAcKAc). Acetyl-Lys (trifluoracetyl)-AMC-substraat wordt gebruikt voor de HDAC4, 5, 7 en 9 assays. Tubastatin A wordt opgelost in DMSO en getest in 10-dosis IC50-modus met 3-voudige seriële verdunning, startend bij 30 μM. Controleverbinding Trichostatin A (TSA) wordt getest in een 10-dosis IC50 met 3-voudige seriële verdunning, startend bij 5 μM. IC50-waarden worden geëxtraheerd door curve-fitting van de dosis/respons-hellingen.
In vivo
Dagelijkse behandeling met Tubastatin A van 0,5 mg/kg remt HDAC6 om de onderdrukkende activiteit van Tregs te bevorderen in muismodellen van ontsteking en auto-immuniteit, waaronder meerdere vormen van experimentele colitis en volledige major histocompatibility complex (MHC)-incompatibele cardiale allograftafstoting.
Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22446682/

Toepassingen (Applications)

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot EGFR / p-AKT / AKT / p-ERK / ERK
S2627-WB1
29665050
Immunofluorescence α-tubulin / Acetylated tubulin HDAC6
S2627-IF1
23798680