Home Epigenetics HDAC Remmer RGFP966

alleen voor onderzoeksdoeleinden

RGFP966 HDAC3-remmer

Cat.nr.S7229

RGFP966 is een HDAC3-remmer met een IC50 van 0,08 μM in een celvrije assay, en vertoont een > 200-voudige selectiviteit ten opzichte van andere HDAC's.
RGFP966 HDAC Remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 362.4

Spring naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: 99.74%
99.74

Producten die vaak samen worden gebruikt met RGFP966

Tubastatin A

It and Tubastatin A decrease total HDAC activity in HLMVEC and reduce the inflammatory and hyper-permeability response to LPS in mice.

(+)-JQ1

It and JQ1 dramatically reduces tumor volume and growth rate and suppresses tumor growth via induction of apoptosis in the glioma xenograft mouse model.

Trichostatin A (TSA)

It and Trichostatin A increase the expression of AKAP12 at both the mRNA and protein levels.

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
APL cells Function assay ≤2 μM 48 h DMSO RGFP966 did not induce apoptosis in APL cells but did reduce clonogenicity and increased maturation. 26447190
Em-Myc lymphoma cells Function assay ≤1 μM 48 h DMSO Cell proliferated significantly more slowly than vehicle-treated controls in the presence or absence of pro-survival BCL-2 overexpression 26447190
HH and Hut78 cells Proliferation assay 10 μM 0, 24, 48, 72 h DMSO Both cell lines were sensitive to treatment with 10 μM 966. However, Hut78 cells exhibited a greater sensitivity than HH cells. 23894374
HH Function assay 10 μM 24 h DMSO increases the acetylation at H3K9/K14, H3K27, and H4K5 23894374
Hut78 Function assay 10 μM 24 h DMSO increases the acetylation at H3K9/K14, H3K27, and H4K5 23894374
HL60 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HL60 cells after 48 hrs in presence of JAK2 inhibitor CYT-387 by CCK-8 assay, IC50 = 1.64 μM. 29940115
K562 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human K562 cells after 48 hrs in presence of JAK2 inhibitor CYT-387 by CCK-8 assay, IC50 = 1.64 μM. 29940115
HEL Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HEL cells after 48 hrs in presence of JAK2 inhibitor CYT-387 by CCK-8 assay, IC50 = 1.64 μM. 29940115
HL60 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HL60 cells after 48 hrs by CCK-8 assay, IC50 = 21.71 μM. 29940115
K562 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human K562 cells after 48 hrs by CCK-8 assay, IC50 = 21.71 μM. 29940115
HEL Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HEL cells after 48 hrs by CCK-8 assay, IC50 = 21.71 μM. 29940115
Sf9 Function assay 60 mins Inhibition of full length human C-terminal His-tagged HDAC3/N-terminal GST-tagged NCOR2 (395 to 489 residues) expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using substrate measured after 60 mins by colorimetric method 29541372
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Molecuulgewicht 362.4 Formule

C21H19FN4O

 Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 1396841-57-8 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles C1=CC=C(C=C1)C=CCN2C=C(C=N2)C=CC(=O)NC3=C(C=C(C=C3)F)N

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

DMSO : 72 mg/mL (198.67 mM)
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
HDAC3
(Cell-free assay)
80 nM
In vitro
RGFP966 is een slow-on/slow-off, competitieve, sterk bindende HDAC-remmer, met een IC50 van 0,08 μM voor HDAC3 en geen effectieve remming van andere HDAC's bij concentraties tot 15 μM. Behandeling van twee CTCL-cellijnen met deze verbinding gedurende 24 uur vóór Western blot-analyse resulteerde in verhoogde acetylering bij H3K9/K14, H3K27 en H4K5, maar niet H3K56ac. Het vermindert celgroei in CTCL (cutaan T-cellymfoom) cellijnen als gevolg van verhoogde apoptose die geassocieerd is met DNA-schade en een verstoorde S-fase progressie. Deze chemische stof veroorzaakt een significante vermindering van de DNA-replicatievorksnelheid binnen het eerste uur van de medicamenteuze behandeling.
Kinase Assay
Deacetyleringstesten
Deacetyleringstesten zijn gebaseerd op de homogene fluorescentierelease-assay. Gezuiverde recombinante enzymen worden geïncubeerd met serieel verdunde remmers in de in de figuren aangegeven concentraties, met voorincubatatietijden variërend van 0 tot 3 uur, in de standaard HDAC-buffer. Acetyl-Lys(Ac)-AMC-substraat (bij 10 μM, overeenkomend met de Km voor zowel HDAC1 als HDAC3) wordt na de voorincubatieperiode toegevoegd. De reactie mag 1 uur duren. De trypsine-peptidase-ontwikkelaar, in een eindconcentratie van 5 mg/ml, wordt na 1 uur toegevoegd, en de fluorescentie-emissie wordt vervolgens gemeten met een Tecan M200 96-wells plaatlezer.
In vivo
RGFP966-behandeling (10 mg/kg) verbetert het langetermijngeheugen voor objectherkenning. Deze verbinding (3 of 10 mg/kg, s.c.) vergemakkelijkt extinctie en voorkomt herstel van cocaïne-geconditioneerde plaatsvoorkeur.
Referenties

Toepassingen (Applications)

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot p-STAT3 / Acetyl-STAT3 / STAT3 / Ac-H3 / Ac-H4 H3K9K14ac / H3 / H3K56ac / H3K27ac / H4K5ac
S7229-WB1
28338101

Veelgestelde vragen (Frequently Asked Questions)

Vraag 1:
Does this product S7229 specifically inhibit HDAC3? Or does it target other HDACs as well?

Antwoord:
In the paper, it is indicated that "this compound is specific for HDAC3, with an IC50 of 0.08 μM and no effective inhibition of any other HDAC at concentrations up to 15 μM." However, we did not perform experiment to confirm this data. Please refer to the following link for detailed information: http://www.pnas.org/content/110/7/2647.long