Home Immunology & Inflammation ROS Activator Disodium (R)-2-Hydroxyglutarate

alleen voor onderzoeksdoeleinden

Disodium (R)-2-Hydroxyglutarate ROS-activator

Cat.nr.S7873

Disodium (R)-2-Hydroxyglutarate (D-α-hydroxyglutaraat dinatrium) is een competitieve remmer van α-ketoglutaraat-afhankelijke dioxygenasen met een Ki van 10,87 ± 1,85 mM.
Disodium (R)-2-Hydroxyglutarate ROS Activator Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 192.08

Spring naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: 99.74%
99.74

Chemische informatie, opslag en stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Molecuulgewicht 192.08 Formule

C5H6Na2O5

 Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 103404-90-6 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen D-α-Hydroxyglutaric acid disodium Smiles C(CC(=O)[O-])C(C(=O)[O-])O.[Na+].[Na+]

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

Water : 38 mg/mL

DMSO : Insoluble
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Ethanol : Insoluble

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
α-ketoglutarate-dependent dioxygenase
In vitro
In U-87MG-cellen fungeert (R)-2-Hydroxyglutarate als een zwakke antagonist van α-KG om α-KG-afhankelijke histon-demethylasen te remmen en verhoogt dimethylering op zowel H3K9 als H3K79. Bovendien remt (R)-2-Hydroxyglutarate de ATP-synthase en mTOR-signalering, wat leidt tot groeistilstand en het doden van tumorcellen.
Kinase Assay
Enzymatische assays
Om de humane JHDM1A/KDM2A demethylase-activiteit ten opzichte van H3K36me2 te bepalen, wordt His-getagd JHDM1A eerst verkregen door pET28a-JHDM1A in Escherichia coli BL21 te transformeren, en proteïne-expressie wordt geïnduceerd door toevoeging van 1 mM IPTG bij 30°C wanneer de celdichtheid 0,5 OD600-eenheden bereikt. Cellen worden gelyseerd door sonificatie en Ni-NTA agarose wordt gebruikt om His-JHDM1A fusieproteïnen te zuiveren. De histon-demethylase-assay wordt uitgevoerd door 2 μg oligonucleosomen, 4 μg gezuiverd His-JHDM1A en/of 10–50 mM L- of D-2-HG te incuberen in histon-demethyleringsbuffer [50 mM HEPES (pH 8,0), 625 μM Fe(NH4)2(SO4)2, 0,1–0,5 mM α-KG, 2 mM ascorbaat] bij 37°C gedurende 2–3 uur, en de reacties worden gestopt door toevoeging van SDS-laadbuffer en vervolgens geanalyseerd door middel van western blotting met behulp van anti-H3K36me2 antilichaam. Om de CeKDM7A demethylase-activiteit ten opzichte van H3K9me2 en H3K27me2 te meten, worden twee synthetische gedi-methylatede peptiden H3K9me2 [ARTKQTARK (me2)STGGKA] en H3K27me2 [QLATKAARK (me2)SAPAS] gebruikt als substraten. Demethylase-assays worden uitgevoerd in aanwezigheid van 10 μg enzym, 1 μg peptide in 20 μl buffer 20 mM Tris-HCl (pH 7,5), 150 mM NaCl, 50 μM Fe(NH4)2(SO4)2, 100 μM α-KG, 2 mM Vc, 10 mM PMSF gedurende 3 uur. Het demethyleringsreactiemengsel wordt ontzout door het door een C18 ZipTip te leiden. Om het remmende effect van 2-HG te onderzoeken, worden verschillende concentraties 2-HG kort met KDM7A geïncubeerd voordat andere reactiemengsels worden toegevoegd. De monsters worden geanalyseerd met een MALDI-TOF/TOF massaspectrometer.
Referenties