Home Transmembrane Transporters Proton Pump Remmer Bafilomycin A1 (Baf-A1)

alleen voor onderzoeksdoeleinden

Bafilomycin A1 (Baf-A1) V-ATPase remmer

Cat.nr.S1413

Bafilomycin A1 (Baf-A1) is een vacuolaire H+-ATPase remmer met een IC50 van 0,44 nM, en het blijkt autophagy te remmen terwijl het apoptosis induceert.
Bafilomycin A1 (Baf-A1) Proton Pump Remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 622.83

Spring naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: >97%
97

Producten die vaak samen worden gebruikt met Bafilomycin A1 (Baf-A1)

3-Methyladenine (3-MA)

It and 3-Methyladenine (3-MA) combination plus irradiation leads to more pronounced and prolonged DNA damage in glioma and breast cancer cells.

Y-27632 Dihydrochloride

Explore the signalling pathways involved in ARV S1133 regulated switch from autophagy to apoptosis.

Torin 1

Explore TGFBI metabolism and autophagy impairment in TBCD corneal fibroblasts using it.

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
human H4 cells Function assay 0.4 μM 24 h Induction of light chain 3-GFP level in human H4 cells at 0.4 uM after 24 hrs by high throughput fluorescence microscopy relative to control 18024584
RAW 264.7 cells Function assay 100 nM Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as increased nitric oxide production in infected cells at 100 nM 19307359
mouse RAW264.7 cells Apoptosis assay 100 nM 16 h Induction of apoptosis in mouse RAW264.7 cells assessed as late apoptotic cells at 100 nM after 16 hrs using annexin V-propidium iodide staining by flow cytometry 19307359
human HeLa cells Function assay 400 nM Induction of autophagy in human HeLa cells expressing EGFP-LC3 assessed as increase in LC3-2 level at 400 nM 18391949
human MCF7 cells Function assay 4 h Inhibition of rapamycin-induced autophagy in human MCF7 cells expressing EGFP-LC3 assessed as decrease in EGFP levels at 100 nM after 4 hrs by Western blotting relative to control 20028134
RAW 264.7 cells Bactericidal activity assay 100 nM 16 h Bactericidal activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as decrease in bacterial growth yield at 100 nM after 16 hrs postinfection by flow cytometry in presence of 10 ug/ml of intracellular replication inhi 19307359
RAW 264.7 cells Antimicrobial activity assay 100 nM Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as increased nitric oxide production in infected cells at 100 nM 19307359
RAW 264.7 cells Antimicrobial activity assay 100 nM 30 mins Antimicrobial activity against Salmonella enterica Typhimurium 14028 infected in RAW 264.7 cells assessed as inhibition of bacterial replication at 100 nM treated 30 mins before infection measured after 2 to 16 hrs postinfection by flow cytometry 19307359
rat 3Y1 cells Function assay Induction of morphological changes in rat 3Y1 cells assessed as elongation of cells 29701963
human Huh7.5.1 cells Antiviral activity 3 h Antiviral activity against HCV genotype 2a JFH-1 in human Huh7.5.1 cells assessed as reduction of viral entry up to 3 hrs by luciferase assay 26396683
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Molecuulgewicht 622.83 Formule

C35H58O9

 Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 88899-55-2 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen N/A Smiles CC1CC(=CC=CC(C(OC(=O)C(=CC(=CC(C1O)C)C)OC)C(C)C(C(C)C2(CC(C(C(O2)C(C)C)C)O)O)O)OC)C

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
H+-ATPase
(Cell-free assay)
0.44 nM
In vitro
Bafilomycin A1 (Baf-A1) is een toxisch macrolide antibioticum afgeleid van Streptomyces griseus, dat de kortsluitstroom remt die wordt geïnduceerd door het buitenste mantel epitheel (OME). De IC50 en maximale remmingsdosis van deze verbinding zijn respectievelijk 0,17 μM en 0,5 μM. Bovendien remt het de zuurinstroom met een IC50-waarde van 0,4 nM. Het remt ook de verzuring dosisafhankelijk, wat resulteert in een lagere quenching en dus een hogere fluorescentie. Deze verbinding voorkomt de vacuolisatie van Hela-cellen geïnduceerd door H. pylori, met een remmende concentratie die 50% van het maximale (ID50) van 4 nM geeft, en is zeer efficiënt in het herstellen van gevacuoliseerde cellen naar een normaal uiterlijk. Het beïnvloedt ook het transport van endocytosemateriaal van vroege naar late endocytische compartimenten, niet alleen door de lage endosomale pH te verdrijven, maar ook door het transport van vroege naar late endosomen in HeLa-cellen te blokkeren. Bij doses van 0,1-1 μM remt het de verzuring van lysosomen volledig, zoals onthuld door de incubatie met acridine-oranje in BNL CL.2- en A431-cellen. Wanneer toegevoegd aan Hanks' gebalanceerde zoutoplossing, wordt de afbraak van endogene eiwitten sterk geremd en hopen talrijke autofagosomen zich op in H-4-II-E-cellen. Het voorkomt ook het verschijnen van endocytose HRP in autofagische vacuolen.
Kinase Assay
ATPase enzymactiviteitstesten
Het ATPase enzymassaymedium bevat 6 mM MgSO4, 50 mM HEPES (pH 7.4), 200 mM Na2SO3 (V-ATPase activator), 0.5 mM natriumorthovanadaat (P-ATPase remmer), 0.5 mM natriumazide (F-ATPase remmer) en 3 mM Na2ATP. Dit medium (1.0 mL), met of zonder toevoeging van de V-type ATPase remmer Bafilomycin A1 (Baf-A1), wordt gedurende 60 minuten bij 23–25 °C geïncubeerd met het gefilterde homogenaat (0.1 mL). De reactie wordt gestopt door toevoeging van 1 mL 3% TCA. Spectrometrische blanco's worden bereid zoals voor de enzymassay, met uitzondering dat het weefselmonster na het zuur wordt toegevoegd. Fosfaatanalyse wordt uitgevoerd door 2 mL 1-butanol en 0.2 mL molybdaatoplossing (5 g ammoniummolybdaat, 22 mL H2SO4 tot 100 mL) toe te voegen. Na 15 seconden vortexen wordt de oplossing geneutraliseerd met 0.5 mL citraatoplossing (100 g/500 mL, pH 7.0) en opnieuw 15 seconden gevortext. De oplossing wordt vervolgens gecentrifugeerd (2000 × g; 3 minuten) om de butanolfase te scheiden en de absorptie van deze fase wordt afgelezen bij 400 nm. Orthofosfaatstandaarden worden bereid (0.1 μM–2.0 μM) en op dezelfde manier behandeld als de enzymactiviteitstesten. Enzymactiviteit wordt uitgedrukt in μmol orthofosfaat dat per uur en per milligram eiwit wordt vrijgemaakt. V-ATPase activiteit wordt beschouwd als het verschil tussen de totale ATPase activiteit gemeten in aanwezigheid van Na2SO3, natriumorthovanadaat en natriumazide en de ATPase activiteit gemeten in aanwezigheid van deze reagentia en van deze verbinding.
In vivo
Bafilomycin A1 (Baf-A1) (1 μM en 0,1 μM) remt de resorptieve activiteit van gekweekte osteoclasten volledig. Deze verbinding remt dosisafhankelijk de Na+-opnamesnelheid bij jonge tilapia met een Ki van 0,16 μM.
Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8446034/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9811698/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1832676/
  • [7] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9639028/
  • [8] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7817803/
  • [9] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10574743/
  • [10] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14713959/

Toepassingen (Applications)

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot Ret / EGFR / p75 NGFR
S1413-WB1
21559479
Growth inhibition assay Cell viability
S1413-viability1
20534000
Immunofluorescence AIF LC3
S1413-IF1
25512644
ELISA TNF-alpha
S1413-ELISA1
26240140

Veelgestelde vragen (Frequently Asked Questions)

Vraag 1:
How to dissolve it？

Antwoord:
S1413 is soluble in DMSO at 6 mg/ml. Please do not use alcohols as solvent, because this compound will degrade in alcohols.