alleen voor onderzoeksdoeleinden
Cat.nr.: S2754
Chemische structuur
| Gerelateerde doelwitten | Bcl-2 Caspase PD-1/PD-L1 Ferroptosis p53 Apoptosis related Synthetic Lethality STAT TNF-alpha Ras |
|---|---|
| Overig IAP Inhibitoren | BV6 SM-164 Birinapant (TL32711) LCL161 GDC-0152 AZD5582 Tolinapant (ASTX660) |
| Cellijnen | Assaytype | Concentratie | Incubatietijd | Formulering | Activiteitsbeschrijving | PMID |
|---|---|---|---|---|---|---|
| EVSA-T | Cytotoxicity assay | 72 hrs | Cytotoxicity against human sensitive EVSA-T cells assessed as inhibition of cell growth after 72 hrs by Alamar Blue assay, EC50 = 0.0021 μM. | 26218264 | ||
| MDA-MB-231 | Cytotoxicity assay | 72 hrs | Cytotoxicity against human sensitive MDA-MB-231 cells assessed as inhibition of cell growth after 72 hrs by Alamar Blue assay, EC50 = 0.019 μM. | 26218264 | ||
| HEK293 | Function assay | 2 hrs | Antagonist activity at full-length FLAG-tagged XIAP (unknown origin) transfected in HEK293 cells assessed as inhibition of interaction with caspase 9 after 2 hrs by immunoprecipitation assay, EC50 = 0.034 μM. | 26218264 | ||
| SKOV3 | Growth inhibition assay | 4 days | Growth inhibition of human SKOV3 cells after 4 days by WST8 assay, IC50 = 0.142 μM. | 21443232 | ||
| MDA-MB-231 | Growth inhibition assay | 4 days | Growth inhibition of human MDA-MB-231 cells after 4 days by WST8 assay, IC50 = 0.144 μM. | 21443232 | ||
| MDA-MB-231 | Function assay | 10 nM | Induction of degradation of cIAP1 in human MDA-MB-231 cells at 10 nM by Western blot analysis | 21443232 | ||
| MDA-MB-231 | Function assay | 100 nM | 15 mins | Induction of degradation of cIAP1 in human MDA-MB-231 cells at 100 nM after 15 mins by Western blot analysis | 21443232 | |
| MDA-MB-231 | Apoptosis assay | 1.5 uM | 12 hrs | Induction of apoptosis in human MDA-MB-231 cells assessed as activation of caspase-3 activity at 1.5 uM after 12 hrs by Western blot analysis | 21443232 | |
| MDA-MB-231 | Apoptosis assay | 1.5 uM | 12 hrs | Induction of apoptosis in human MDA-MB-231 cells assessed as activation of PARP cleavage at 1.5 uM after 12 hrs by Western blot analysis | 21443232 | |
| MDA-MB-231 | Antitumor assay | 30 mg/kg | 2 weeks | Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in SCID mouse assessed inhibition of tumor growth at 30 mg/kg, po administered daily for 5 days/week for 2 weeks | 21443232 | |
| MDA-MB-231 | Antitumor assay | 100 mg/kg | 2 weeks | Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in SCID mouse assessed inhibition of tumor growth at 100 mg/kg, po administered daily for 5 days/week for 2 weeks | 21443232 | |
| MDA-MB-231 | Antitumor assay | 100 mg/kg | every 3 days | Antitumor activity against human MDA-MB-231 cells xenografted in Balb/c SCID mouse assessed as tumor growth inhibition at 100 mg/kg, po qd measured every 3 days | 26218264 | |
| DAOY | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells | 29435139 | |||
| SJ-GBM2 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells | 29435139 | |||
| A673 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells | 29435139 | |||
| SK-N-MC | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells | 29435139 | |||
| BT-37 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells | 29435139 | |||
| NB-EBc1 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells | 29435139 | |||
| Saos-2 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Saos-2 cells | 29435139 | |||
| LAN-5 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells | 29435139 | |||
| BT-12 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells | 29435139 | |||
| OHS-50 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells | 29435139 | |||
| SK-N-MC | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-MC cells | 29435139 | |||
| TC32 | qHTS assay | qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for TC32 cells | 29435139 | |||
| Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken | ||||||
| Molecuulgewicht | 561.71 | Formule | C32H43N5O4 |
Opslag (vanaf de datum van ontvangst) | |
|---|---|---|---|---|---|
| CAS-nr. | 1071992-99-8 | SDF downloaden | Opslag van stamoplossingen |
|
|
| Synoniemen | ARRY-334543, Debio1143, SM-406 | Smiles | CC(C)CC(=O)N1CCC2CCC(N2C(=O)C(C1)NC(=O)C(C)NC)C(=O)NC(C3=CC=CC=C3)C4=CC=CC=C4 | ||
|
In vitro |
DMSO
: 112 mg/mL
(199.39 mM)
Ethanol : 112 mg/mL Water : Insoluble |
|
In vivo |
|||||
Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)
Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)
Berekeningsresultaten:
Werkconcentratie: mg/ml;
Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.
Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.
Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.
| Targets/IC50/Ki |
cIAP1-BIR3
(cell-free assay) 1.9 nM(Ki)
cIAP2-BIR3
(cell-free assay) 5.1 nM(Ki)
XIAP-BIR3
(cell-free assay) 66.4 nM(Ki)
|
|---|---|
| In vitro |
AT-406 is a Smac mimetic and appears to mimic closely the AVPI peptide in both hydrogen bonding and hydrophobic interactions with XIAP, with additional hydrophobic contacts with W323 of XIAP. AT-406 is more sensitive to these IAPs than Smac AVPI peptide with 50-100 fold binding affinities. AT-406 (at 1 μM) completely restores the activity of caspase-9, which is suppressed by 500 nM XIAP BIR3 in a cell-free system. In MDA-MB-231 cell, AT-406 induces rapid cellular cIAP1 degradation and also pulls down the cellular XIAP protein. AT-406 effectively inhibits lots of human cancer cell lines and shows IC50 of 144 and 142 nM in MDA-MB-231 cell and SK-OV-3 ovarian cell, with low toxicity against normal-like human breast epithelial MCF-12F cells and primary human normal prostate epithelial cells. AT-406 induces apoptosis in MDA-MB-231 cell by inducing activation of caspase-3 and cleavage of PARP.
|
| Kinase Assay |
Op fluorescentiepolarisatie gebaseerde assays voor XIAP, cIAP1 en cIAP2 BIR3-eiwitten
|
|
FL-AT-406 (het fluorescent gelabelde AT-406) wordt gebruikt om een reeks nieuwe FP-assays te ontwikkelen voor het bepalen van de bindingsaffiniteiten van Smac-mimetica aan XIAP, cIAP-1 en cIAP-2 BIR3-eiwitten. De Kd-waarde van FL-AT-406 voor elk IAP-eiwit wordt bepaald door titratie-experimenten met een vaste concentratie FL-AT-406 en verschillende concentraties van het eiwit tot volledige verzadiging. Fluorescentiepolarisatiewaarden worden gemeten met een Infinite M-1000 plaatlezer in Microfluor 2 96-wells, zwarte, rondbodemplaten. Aan elk putje worden FL-AT-406 (respectievelijk 2, 1 en 1 nM voor experimenten met XIAP BIR3, cIAP-1 BIR3 en cIAP-2 BIR3) en verschillende concentraties van het eiwit toegevoegd tot een eindvolume van 125 μL in de assaybuffer (100 mM kaliumfosfaat, pH 7,5, 100 μg/mL bovine γ-globuline, 0,02% natriumazide, met 4% DMSO). Platen worden gemengd en 2-3 uur bij kamertemperatuur geïncubeerd met zacht schudden. De polarisatiewaarden in millipolarisatie-eenheden (mP) worden gemeten bij een excitatiegolflengte van 485 nm en een emissiegolflengte van 530 nm. Evenwichts dissociatieconstanten (Kd) worden vervolgens berekend door de sigmoïdale dosisafhankelijke FP-toenames te fitten als functie van eiwitconcentraties met behulp van Graphpad Prism 5.0-software. In competitieve bindingsexperimenten voor XIAP3 BIR3 wordt AT-406 geïncubeerd met 20 nM XIAP BIR3-eiwit en 2 nM FL-AT-406 in de assaybuffer (100 mM kaliumfosfaat, pH 7,5; 100 μg/mL bovine γ-globuline; 0,02% natriumazide). In competitieve bindingsexperimenten voor cIAP1 BIR3-eiwit worden 3 nM eiwit en 1 nM FL-AT-406 gebruikt. In competitieve bindingsexperimenten voor cIAP2 BIR3 worden 5 nM eiwit en 1 nM FL-AT-406 gebruikt. Voor elk competitief bindingsexperiment worden polarisatiewaarden gemeten na 2-3 uur incubatie met een Infinite M-1000 plaatlezer. De IC50-waarde, de inhibitorconcentratie waarbij 50% van de gebonden tracer wordt verdrongen, wordt bepaald uit de plot met behulp van niet-lineaire kleinste-kwadratenanalyse. Curvenpassing wordt uitgevoerd met de PRISM-software. Een Ki-waarde voor AT-406 wordt berekend.
|
|
| In vivo |
AT-406 has good pharmacokinetic (PK) properties and oral bioavailability in mice, rats, non-human primates, and dogs. In the MDA-MB-231 xenograft, AT-406 effectively induces cIAP1 degradation and processing of procaspase-8, cleavage of PARP in tumor tissues at 100 mg/kg with well toleration even at 200 mg/kg. AT-406 induces significant tumor growth inhibition with p of 0.0012 at 100 mg/kg.
|
Referenties |
| Methoden | Biomarkers | Afbeeldingen | PMID |
|---|---|---|---|
| Western blot | cIAP-1 / XIAP / Mcl-1 / pS6K1 / Cleaved PARP |
|
28036295 |
| Growth inhibition assay | Cell viability |
|
28036295 |
(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)
| NCT-nummer | Werving | Aandoeningen | Sponsor/medewerkers | Startdatum | Fasen |
|---|---|---|---|---|---|
| NCT01265199 | Terminated | Acute Myelogenous Leukemia (AML) |
Ascenta Therapeutics|The Leukemia and Lymphoma Society |
February 2011 | Phase 1 |
| NCT01078649 | Completed | Cancer|Solid Tumors|Lymphoma|Malignancy |
Debiopharm International SA |
March 29 2010 | Phase 1 |