Home Epigenetics HDAC Remmer Sodium butyrate

alleen voor onderzoeksdoeleinden

Sodium butyrate HDAC Remmer

Cat.nr.: S1999

Sodium butyrate (NaB, boterzuur natriumzout), natriumzout van boterzuur, is een histone deacetylase remmer en bindt competitief aan de zinkplaatsen van klasse I en II HDACs. Deze verbinding remt de celcyclusprogressie, bevordert differentiatie en induceert apoptosis en autophagy in verschillende soorten kankercellen.
Sodium butyrate HDAC Remmer Chemical Structure

Chemische structuur

Molecuulgewicht: 110.09

Spring naar

Kwaliteitscontrole (Quality Control)

Batch: Zuiverheid: 100.00%
100.00

Celkweek, behandeling & werkzame concentratie
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

Cellijnen Assaytype Concentratie Incubatietijd Formulering Activiteitsbeschrijving PMID
human K562 cells Proliferation assay 1 mM Antiproliferative activity against human K562 cells at 1 mM in presence of guanosine
human H1299 cells Function assay 7 days Inhibition of human USP1/UAF1 in human H1299 cells assessed as reduction in colony formation after 7 days, EC50=3 μM
human JEG3 cells Function assay Inhibition of aromatase in human JEG3 cells by scintillation spectrometry, IC50=0.0015 μM
Klik om meer experimentele gegevens over cellijnen te bekijken

Chemische informatie, opslag en stabiliteit (Chemical Information, Storage & Stability)

Molecuulgewicht 110.09 Formule

C4H7NaO2

 Opslag (vanaf de datum van ontvangst)
CAS-nr. 156-54-7 SDF downloaden Opslag van stamoplossingen

Synoniemen NaB, Butanoic acid sodium salt Smiles CCCC(=O)[O-].[Na+]

Oplosbaarheid (Solubility)

In vitro
Batch:

Water : 22 mg/mL

Ethanol : 8 mg/mL

DMSO : Insoluble
(Met vocht verontreinigd DMSO kan de oplosbaarheid verminderen. Gebruik verse, watervrije DMSO.)

Molariteitscalculator

Massa Concentratie Volume Molecuulgewicht
Verdunningscalculator Molecuulgewichtcalculator

In vivo
Batch:

In vivo formulatiecalculator (heldere oplossing)

Stap 1: Voer onderstaande informatie in (Aanbevolen: een extra dier om rekening te houden met verlies tijdens het experiment)

mg/kg g μL

Stap 2: Voer de in vivo formulering in (Dit is alleen de calculator, geen formulering. Neem eerst contact met ons op als er geen in vivo formulering is in de sectie oplosbaarheid.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

Berekeningsresultaten:

Werkconcentratie: mg/ml;

Methode voor het bereiden van DMSO-moedervloeistof: mg geneesmiddel vooropgelost in μL DMSO ( Concentratie moedervloeistof mg/mL, Neem eerst contact met ons op als de concentratie de DMSO-oplosbaarheid van de batch van het geneesmiddel overschrijdt. )

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toeμL PEG300, mengen en verhelderen, daarna toevoegenμL Tween 80, mengen en verhelderen, daarna toevoegen μL ddH2O, mengen en verhelderen.

Methode voor het bereiden van in vivo formulering: Neem μL DMSO moedervloeistof, voeg daarna toe μL Maïsolie, mengen en verhelderen.

Opmerking: 1. Zorg ervoor dat de vloeistof helder is voordat u het volgende oplosmiddel toevoegt.
2. Zorg ervoor dat u het/de oplosmiddel(en) in de juiste volgorde toevoegt. U moet ervoor zorgen dat de verkregen oplossing, bij de vorige toevoeging, een heldere oplossing is voordat u verdergaat met het toevoegen van het volgende oplosmiddel. Fysieke methoden zoals vortexen, ultrasoon of een warmwaterbad kunnen worden gebruikt om het oplossen te bevorderen.

Werkingsmechanisme (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
Histone deacetylase
In vitro
Butyrate mediates growth inhibition of colonic cancer cells and thereby to elucidate the molecular link between a high-fiber diet and the arrest of colon carcinogenesis. This compound induces p21 mRNA expression in an immediate-early fashion, through transactivation of a promoter cis-element(s) located within 1.4 kb of the transcriptional start site, independent of p53 binding. Sodium butyrate, at physiological concentrations, induces apoptosis in 2 adenoma cell lines, RG/C2 and AA/Cl, and in the carcinoma cell line PC/JW/FI. It exerts potent effects on a variety of colonic mucosal functions such as inhibition of inflammation and carcinogenesis, reinforcing various components of the colonic defence barrier and decreasing oxidative stress. This chemical inhibits most HDAC except class III HDAC and class II HDAC6 and -10. It also is the most effective fatty acid in stimulating or repressing the expression of specific genes.
In vivo
Sodium butyrate significantly extends survival in a dose-dependent manner, improves body weight and motor performance, and delays the neuropathological sequelae in the R6/2 transgenic mouse model of Huntington's disease (HD). This compound also increases histone and specificity protein-1 acetylation and protects against 3-nitropropionic acid neurotoxicity.
Referenties
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12840228/
  • [5] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14561870/
  • [6] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/649576/

Toepassingen (Applications)

Methoden Biomarkers Afbeeldingen PMID
Western blot Cyclin D3 / CDK4 / CDK6 / CDK2 p15INK4b / p21Cip1 Phospho-H3 Ser10 / Acetyl-H3Lys9 / Acetyl-H3Lys14 / Dimethyl-H3
S1999-WB1
24280698
Immunofluorescence Acetyl-H3Lys9
S1999-IF1
24280698

Informatie over klinische proeven (Clinical Trial Information)

(gegevens van https://clinicaltrials.gov, bijgewerkt op 2024-05-22)

NCT-nummer Werving Aandoeningen Sponsor/medewerkers Startdatum Fasen
NCT00800930 Completed
Shigellosis
International Centre for Diarrhoeal Disease Research Bangladesh|Swedish International Development Cooperation Agency (SIDA)|Karolinska Institutet
 January 2005 Phase 2